đŸ‘€ A. Izzo

🔍 Search 📋 Browse đŸ·ïž Tags ❀ Favourites ➕ Add 🧬 Extraction
3
Articles
3
Name variants
Also published as: L.T. Izzo, M. Izzo
articles
L. Volpicella, G. Punzi, V. Porcelli +494 more · 2025 · Biomolecules · MDPI · added 2026-04-20
L. Volpicella, G. Punzi, V. Porcelli, N. Gambacorta, L. Trisolini, C.L. Pierri, A. De Grassi, D.M. Muoio, R.C. Noland, J.P. Kovalik, S.E. Seiler, M.N. Davies, K.L. Debalsi, O.R. Ilkayeva, R.D. Stevens, I. Kheterpal, J. Zhang, J. Hsu, N. Fatuzzo, N. Weng, W. Michno, W. Dong, M. Kienle, Y. Dai, A. Pasca, M. Abu-Remaileh, N. Rasgon, R.R. Ramsay, R.D. Gandour, F.R. van der Leij, M.A.K. Westin, M.C. Hunt, S.E.H. Alexson, O.J. Martin, D.H. Slentz, J. An, C.B. Newgard, T.R. Koves, K.H. Fisher-Wellman, C.-T. Lin, T.E. Ryan, L.R. Reese, L.A.A. Gilliam, B.L. Cathey, D.S. Lark, C.D. Smith, P.D. Neufer, J.R. Gooding, K.E. Wong, A.H. Wittmann, L. Lindeboom, L. Kjalarsdottir, J.W. Thompson, L.G. Dubois, M.J. Brosnan, T.P. Rolph, P.A. Grimsrud, V. Mezhnina, R. Pearce, A. Poe, N. Velingkaar, A. Astafev, O.P. Ebeigbe, K. Makwana, Y. Sandlers, R.V. Kondratov, M.A.B. Melone, A. Valentino, S. Margarucci, U. Galderisi, A. Giordano, G. Peluso, N.D. Amoedo, S. Sarlak, E. Obre, P. Esteves, H. BĂ©gueret, Y. Kieffer, B. Rousseau, A. Dupis, J. Izotte, N. Bellance, N. Giangregorio, A. Tonazzi, G. Incampo, V. Tragni, C. Indiveri, G. Fiermonte, E. Paradies, S. Todisco, C.M.T. Marobbio, F. Palmieri, T. Haitina, J. Lindblom, T. Renström, R. Fredriksson, A. Vozza, F. De Leonardis, G. Parisi, F.M. Lasorsa, L. Muto, L. Capobianco, G. Agrimi, A. Russo, P. Scarcia, V.A. Zammit, G. Jogl, L. Tong, A.C. Rufer, R. Thoma, M. Hennig, Y.S. Hsiao, I. Lasheras-Otero, I. Feliu, A. Maillo, H. Moreno, M. Redondo-Muñoz, P. Aldaz, A. Bocanegra, A. Olias-Arjona, F. Lecanda, J. Fernandez-Irigoyen, B. Musio, V. Pesce, M.M. Cavalluzzi, G. Petrosillo, G. La Piana, M.N. Sgobba, N. SchlosserovĂĄ, L. Cafferati Beltrame, R. Di Lorenzo, G. Primiano, A. Tummolo, G. Paterno, R. Gorgoglione, M. Volpicella, V. Iacobazzi, V. Infantino, P. Convertini, L. Console, C. Lanave, C. Saccone, S.M. Houten, R.J.A. Wanders, D. Lacombe, R. Rossignol, C. Caggese, D. D’Elia, G. Pesole, M. Montaruli, L. Laera, F. Colella, V. Scaglione, S. Barile, A.L. Francavilla, D.I. De Luca, X. Wang, C. Yang, C. Huang, W. Wang, G. Chen, B. Bao, Y. Cheng, M. Tian, J. Song, L. Zheng, Q. Tong, R. Vishwa, B. BharathwajChetty, S. Girisa, B.S. Aswani, M.S. Alqahtani, M. Abbas, M. Hegde, A.B. Kunnumakkara, L.T.M. Le, J.R. Thompson, P.X. Dang, J. Bhandari, A. Alam, K. Zacharowski, B. Blackburn, C. Thiemermann, R. Shi, Y. Zhang, Y. Shi, S. Shi, L. Jiang, K. Jaudzems, J. Kuka, A. Gutsaits, K. Zinovjevs, I. Kalvinsh, E. Liepinsh, M. Dambrova, M. Tsoko, F. Beauseigneur, J. Gresti, I. Niot, J. Demarquoy, J. Boichot, J. Bezard, L. Rochette, P. Clouet, M. Kuwajima, H. Harashima, M. Hayashi, S. Ise, M. Sei, K.-m. Lu, H. Kiwada, Y. Sugiyama, K. Shima, D.L. Jenkins, O.W. Griffith, L.T. Izzo, S. Trefely, C. Demetriadou, J.M. Drummond, T. Mizukami, N. Kuprasertkul, A.T. Farria, P.T.T. Nguyen, N. Murali, L. Reich, H. Mao, A. Angelini, S. Li, G. Wang, L. Li, C. Patterson, X. Pi, L. Xie, A.G. Cordente, E. LĂłpez-Viñas, M.I. VĂĄzquez, P. GĂłmez-Puertas, G. Asins, D. Serra, F.G. Hegardt, L. Govindasamy, T. Kukar, W. Lian, B. Pedersen, Y. Gu, M. Agbandje-McKenna, S. Jin, R. McKenna, D. Wu, A.R. Kim, R.J. Rylett, B.H. Shilton, Y. Cai, C.N. Cronin, A.G. Engel, K. Ohno, L.B. Hersh, D.W. Rodgers, J.D. McGarry, N.F. Brown, A. Mattevi, A.M. Waterhouse, J.B. Procter, D.M.A. Martin, M. Clamp, G.J. Barton, M.A. Larkin, G. Blackshields, N.P. Brown, R. Chenna, P.A. McGettigan, H. McWilliam, F. Valentin, I.M. Wallace, A. Wilm, R. Lopez, J.F. Chase, S. Violante, L. Ijlst, J. Ruiter, J. Koster, H. van Lenthe, M. Duran, I.T. de Almeida, F.V. Ventura, P.K. Tubbs, M. Morillas, B. RubĂ­, J. Clotet, J. Ariño, A. Valencia, K. Kashfi, R.L. Mynatt, E.A. Park, G.A. Cook, R.J. Wanders, W.L. Delano, S. Bromberg, A.C. Wallace, R.A. Laskowski, J.M. Thornton, T.R. Altamimi, P.D. Thomas, A.M. Darwesh, N. Fillmore, M.U. Mahmoud, L. Zhang, A. Gupta, R. Al Batran, J.M. Seubert, G.D. Lopaschuk, M.A. Schroeder, H.J. Atherton, M.S. Dodd, P. Lee, L.E. Cochlin, G.K. Radda, K. Clarke, D.J. Tyler, A. Pop, M. Williams, E.A. Struys, M. MonnĂ©, E.E.W. Jansen, W.A. Kanhai, M.R.F. Ojeda, A. Tessa, C. Dionisi-Vici, M.R. Baumgartner, Y.H. Chien, C. Loguercio, H.O. De Baulny, M.-C. Nassogne, M. Schiff, R. Wibom, V. Töhönen, M. Barbaro, F.H. Sterky, T. Kucinski, K. Naess, M. Jonsson, S. Edvardson, C. Jalas, D. Soiferman, Y. Kellner, A. Shaag, S.H. Korman, N.D. Fraenkel, M. Ruggiu, M.F. Hossain, A. Menga, A. Castegna, F. Invernizzi, S. Baratta, R. Pons, W. Chung, B. Garavaglia, A. Ribes, R. Parini, M.D. Huertas, M.A. Shahroor, I. Dweikat, M.A. Di Noia, M. Gur, G. Agostino, T. Rinaldi, G. Gasparre, A. Onofrio, G. Redavid, A. Santarsiero, N.C. Williams, D. Iacobazzi, G. De Stefano, L.A.J. O’Neill, X. Li, F. Zhao, Z. Zhao, X. Zhao, H. Meng, D. Zhang, S. Zhao, M. Ding, C. Amat di San Filippo, M.R.G. Taylor, L. Mestroni, L.D. Botto, N. Longo, K. GotvaldovĂĄ, J. Ć pačkovĂĄ, K. SmolkovĂĄ, G. Benard, F. Furt, H. Begueret, E. Passerieux, J.P. Delage, J.M. Baste, P. Moreau, J. NovotnĂœ, K. BaslarovĂĄ, P. JeĆŸek, L. RossmeislovĂĄ, J. Gojda, E.M. Palmieri, R. Holewinski, C.L. McGinity, N. Maio, J.M. Weiss, K.M. Miranda, T.A. Rouault, T. Andresson, S. Sharma, X. Sun, S. Agarwal, R. Rafikov, S. Dasarathy, S. Kumar, S.M. Black, J.M. Rutkowsky, T.A. Knotts, K.D. Ono-Moore, C.S. McCoin, S. Huang, D. Schneider, S. Singh, S.H. Adams, D.H. Hwang, L. Amadori, C. Calcagno, D.M. Fernandez, S. Koplev, N. Fernandez, R. Kaur, P. Mury, N.S. Khan, S. Sajja, R. Shamailova, A. Ta-Shma, P. Stepensky, S. Zenvirt, O. Elpeleg, A.J.J.T. Rein, T. Hu, C.H. Liu, M. Lei, Q. Zeng, H. Tang, N. Zhang, C. Garcia, C.J. Andersen, C.N. Blesso, M. Wang, K. Wang, X. Liao, H. Hu, L. Chen, L. Meng, W. Gao, Q. Li, G. Ghilardi, L. Paruzzo, J. Svoboda, E.A. Chong, A.A. Shestov, I.J. Cohen, G. Gabrielli, S.D. Nasta, P. Porazzi, J.B. Baell, J.W.M. Nissink, N. Wiedemar, D.A. Hauser, P. MĂ€ser, M. Favia, A. Muscella, L. Guerra, C. Jose, T. Zhao, X. Mu, Q. You, A.D.R. Campos-Contreras, M. DĂ­az-Muñoz, F.G. VĂĄzquez-Cuevas, L. Nicassio, F. Fracasso, G. Sirago, C. Musicco, A. Picca, E. Marzetti, R. Calvani, P. Cantatore, M.N. Gadaleta, P. Cassano, A.M.S. Lezza, V. Capelli, A.M. Timperio, M. Calvani, L. Mosconi Show less
Carnitine O-acetyltransferase (CRAT) is a key mitochondrial enzyme involved in maintaining metabolic homeostasis by mediating the reversible transfer of acetyl groups between acetyl-CoA and carnitine. Show more
Carnitine O-acetyltransferase (CRAT) is a key mitochondrial enzyme involved in maintaining metabolic homeostasis by mediating the reversible transfer of acetyl groups between acetyl-CoA and carnitine. This enzymatic activity ensures the optimal functioning of mitochondrial carbon flux by preventing acetyl-CoA accumulation, buffering metabolic flexibility, and regulating the balance between fatty acid and glucose oxidation. CRAT’s interplay with the mitochondrial carnitine shuttle, involving carnitine palmitoyltransferases (CPT1 and CPT2) and the carnitine carrier (SLC25A20), underscores its critical role in energy metabolism. Emerging evidence highlights the structural and functional diversity of CRAT and structurally related acetyltransferases across cellular compartments, illustrating their coordinated role in lipid metabolism, amino acid catabolism, and mitochondrial bioenergetics. Moreover, the structural insights into CRAT have paved the way for understanding its regulation and identifying potential modulators with therapeutic applications for diseases such as diabetes, mitochondrial disorders, and cancer. This review examines CRAT’s structural and functional aspects, its relationships with carnitine shuttle members and other carnitine acyltransferases, and its broader role in metabolic health and disease. The potential for targeting CRAT and its associated pathways offers promising avenues for therapeutic interventions aimed at restoring metabolic equilibrium and addressing metabolic dysfunction in disease states. Show less
📄 PDF DOI: 10.3390/biom15020216
amino-acid mitochondria review
Q. Dan, X. Dan, R. Jiang +1557 more · 2023 · Advanced Science · Wiley · added 2026-04-20
Q. Dan, X. Dan, R. Jiang, Z. Wang, D. Dai, L. Sun, A. Caschera, L. Lazzara, D. Piergallini, B. Ricci, A. Tuscano, F. Vanzulli, D. R. Czeyda‐Pommersheim, J. R. Martin, B. Costello, J. Kalb, N. Wallyn, S. Anton, T. F. Akram, S. N. Vandamme, M. A. Gandhi, J. G. Brown, D. A. Wong, C. B. Aguirre, N. Sirlin, E. Naseri, F. Ajorlou, Y. Asghari, N. Pilehvar‐Soltanahmadi, P. Tsapis, I. Dey, N. Blakey, V. T. C. Stone, X. Tsang, T. T. W. Li, G. S. Wong, K. D. Filonov, L.‐M. Piatkevich, J. Ting, K. Zhang, V. V. Kim, L. Verkhusha, A. R. Truong, P. Ferre‐D'Amare, P. J. Charalampaki, A. Proskynitopoulos, M. Heimann, A. J. Nakamura, M. G. Sinnamon, Y. Neuwirth, S. M. Song, S. Schultz, X. Liu, C. M. Xu, G. C. Sehgal, T. Karakousis, M. von Knorring, A. Mogensen, S. V. Upadhyay, D. Dalvi, A. Maresca, M. Lakshmanan, A. Abedi, A. Bar‐Zion, G. J. Farhadi, J. O. Lu, D. Szablowski, S. Wu, M. G. Yoo, N. Shapiro, S. von Knebel Doeberitz, L. Maksimovic, D. Loi, A. Paech, G. J. Lakshmanan, A. Lu, S. P. Farhadi, M. Nety, A. Kunth, D. Lee‐Gosselin, R. W. Maresca, M. Bourdeau, J. Yin, C. Yan, D. Witte, F. S. Malounda, L. Foster, M. G. Schroder, M. G. Shapiro, R. M. Shapiro, L. J. Ramirez, G. Sperling, J. Sun, A. Sun, D. V. Pines, V. S. Schaffer, H. Bajaj, M. W. Kang, S. Kang, H. S. Kashiwagi, V. H. Choi, A. E. Roberts, A. J. Frias, C. C. Fordham, N. Hacherl, K. Patel, B. Jones, M. Myers, J. Abraham, M. Gendreau, A. B. Ormo, K. Cubitt, L. A. Kallio, R. Y. Gross, S. J. Tsien, J. Remington, F. Wiedenmann, G. U. Oswald, N. C. Nienhaus, G. H. Shaner, M. W. Patterson, R. N. Davidson, M. W. Day, N. C. Davidson, R. E. Shaner, P. A. Campbell, B. N. G. Steinbach, A. E. Giepmans, R. Y. Palmer, M. M. Tsien, O. V. Karasev, K. A. Stepanenko, K. K. Rumyantsev, V. V. Turoverov, K. Verkhusha, C. Vintersten, M. Monetti, P. Z. Gertsenstein, L. Zhang, S. Laszlo, A. Biechele, A. Nagy, S. Amsterdam, N. Lin, T. Hopkins, A. Matsumoto, K. Suetsugu, M. Hasegawa, Y. Nakamura, H. Shibata, T. Aoki, H. Kunisada, M. Tsurumi, M. Shimizu, R. M. Bouvet, Q. T. Hoffman, E. S. Nguyen, T. A. Olson, T. Aguilera, M. Jiang, L. G. Scadeng, R. Y. Ellies, M. Tsien, B. Zhao, H. Li, F. Zhang, N. C. Zhang, J. C. Rockwell, S. H. Lagarias, S. J. Bhoo, J. Davis, B. Walker, R. D. Karniol, S. J. Vierstra, A. V. Davis, R. D. Vener, L. Vierstra, P. A. O'Brien, K. Hosick, D. E. John, T. D. Stec, X. Hinds, A. Shu, M. Z. Royant, T. A. Lin, V. Aguilera, P. A. Lev‐Ram, R. Y. Steinbach, K. D. Tsien, F. V. Piatkevich, V. V. Subach, D. M. Verkhusha, V. V. Shcherbakova, M. Shcherbakova, A. V. Baloban, M. Emelyanov, P. Brenowitz, V. V. Guo, R. Verkhusha, Y. Liu, K. Xu, Z. Xu, S. K. Dai, R. Donnelly, S. P. H. Cabrera, J. R. Mao, B. Christin, W. Wu, J. J. Guo, J. S. Bravo‐Cordero, J. E. Condeelis, L. Segall, D. M. Hodgson, O. V. Shcherbakova, K. K. Stepanenko, V. V. Baloban, J. S. Verkhusha, K. Y. Paige, S. R. Wu, E. V. Jaffrey, P. J. Dolgosheina, R. L. Unrau, M. D. Strack, S. R. Disney, K. D. Jaffrey, M. C. Warner, W. Chen, R. L. Song, A. Strack, S. R. Thorn, A. R. Jaffrey, A. Ferre‐D'Amare, E. Autour, M. Westhof, G. S. Ryckelynck, J. D. Filonov, N. Moon, S. R. Svensen, A. Jaffrey, S. C. Y. Autour, A. D. Jeng, A. Cawte, A. Abdolahzadeh, S. S. S. Galli, D. Panchapakesan, M. Rueda, P. J. Ryckelynck, A. Unrau, M. Arora, A. Sunbul, W. Jaeschke, G. S. Song, H. Filonov, M. Kim, X. Hirsch, J. D. Li, S. R. Moon, M. Jaffrey, J. I. Jaeschke, M. N. Traylor, A. C. Pernik, S. K. Sternisha, K. G. McBrayer, Y. Abdullah, Y. Harada, T. Murayama, E. Takamatsu, H. Otsuji, S. Tanaka, F. Broekx, S. Weyns, W. De Vleeschouwer, S. Stummer, S. Stocker, H. Wagner, C. Stepp, C. Fritsch, A. E. Goetz, R. Goetz, H. J. Kiefmann, W. Reulen, U. Stummer, T. Pichlmeier, O. D. Meinel, F. Wiestler, H. J. Zanella, A. L.‐G. S. Reulen, A. P. K. K. K. Group, R. Mudiyanselage, M. A. Wu, K. Leon‐Duque, M. Ren, J. You, J. Vachtenheim, E. Borovansky, I. Dimitrow, A. Riemann, M. J. Ehlers, J. Koehler, P. Norgauer, K. Elsner, M. Koenig, S. Kaatz, F. Seidenari, C. Arginelli, P. M. W. Dunsby, K. French, C. Koenig, C. Magnoni, G. Talbot, J. Ponti, P. Staley, A. K. Grogan, H. Samadi, M. S. Cui, X. Cohen, E. I. Yang, E. V. Galanzha, P. M. Shashkov, J. Y. Spring, V. P. Suen, E. I. Zharov, V. P. Galanzha, Z. Zharov, W. Habli, R. AlChamaa, H. Saab, M. L. Kadara, Y. Khraiche, F. Sun, Z. Ding, R. Chen, C. Zhang, Y. Li, Y. Xu, R. Zhang, X. Ni, G. Li, Y. Yang, P. J. Sun, B. Stang, X. Fan, X. Yang, S. Li, H. Lv, J. Zhang, L. Li, B. Wang, X. Qu, R. Peng, D. Zhang, D. Sheng, Y. Wang, K. Yao, Z. Yang, L. Wang, Y. Deng, S. Chen, M. Sirsi, L. Borden, S. V. Abou‐Elkacem, J. K. Bachawal, F. Willmann, F. Pfeifer, S. Pfeifer, P. DasSarma, A. Arora, A. Lakshmanan, A. Nety, R. W. Lee‐Gosselin, D. Bourdeau, M. G. Maresca, A. Shapiro, A. E. Oren, D. Walsby, J. M. Lee‐Gosselin, Y.‐L. Melis, R. W. Ni, D. M. Bourdeau, M. G. Kochmann, J. O. Shapiro, A. Szablowski, M. G. Bar‐Zion, P. W. Shapiro, A. Goodwill, M. Neogy, F. S. Yin, D. V. Foster, S. M. Schaffer, L. Conolly, J. Xie, T. Song, F. Jiang, R. C. Yan, M. T. Hurt, M. Buss, K. Duan, M. Y. Wong, D. P. You, M. B. Sawyer, P. Swift, P. Dutka, D. R. Barturen‐Larrea, Z. Mittelstein, M. H. Jin, R. Farhadi, M. G. Deshpande, G. H. Farhadi, D. P. Ho, R. W. Sawyer, M. G. Bourdeau, D. Shapiro, T. Maresca, A. Payen, B. Lee‐Gosselin, D. Ling, C. Malounda, M. Demene, M. G. Tanter, Z. Lakshmanan, S. P. Jin, D. P. Nety, A. Sawyer, M. B. Malounda, D. Swift, T. Hao, F. Ai, X. Goerner, V. M. Hu, M. Runge, K. M. Tweedle, A. H. Ward, R. S. Aletras, L. Balaban, T. J. Schroeder, C. Lowery, D. E. Hilty, A. Wemmer, J. J. Pines, J. Neil, A. M. Badaut, A. Fukuda, K. G. Jullienne, Y. Petry, V. S. Jasanoff, E. Lelyveld, F. H. Brustad, A. Arnold, S. M. Jasanoff, J. M. Cohen, J. G. Rifkind, E. Mohanty, P. C. M. Nagababu, S. M. van Zijl, J. A. Eleff, J. M. E. Ulatowski, A. M. Oja, R. J. Ulug, R. A. Traystman, K. Kauppinen, P. Uludag, J. P. B. Blinder, S. P. O'Connor, J. C. Robinson, H. Waterton, G. Kroll, T. Zaharchuk, J. J. Christen, M. Heit, B. Iv, G. Jacobi, S. Bongartz, A.‐C. Partovi, M. Schulte, A. B. Aschwanden, M. G. Lumsden, M. Davies, G. P. Loebe, S. Noon, J. K. Karimi, D. Lyo, R. W. Staub, D. Huegli, M. G. Bilecen, G. G. Shapiro, P. A. Westmeyer, J. O. Romero, B. Szablowski, A. Kuester, C. R. Shah, R. Otey, F. H. Langer, A. Jasanoff, L. X. Hai, T. Cai, V. S. Lee, A. Lelyveld, T. Jasanoff, L. X. Lee, V. S. Cai, A. Hai, H. Jasanoff, B. Gunshin, U. V. Mackenzie, Y. Berger, M. F. Gunshin, W. F. Romero, S. Boron, J. L. Nussberger, M. A. Gollan, B. B. Hediger, K. U. Bartelle, G. A. Szulc, J. J. Suero‐Abreu, D. H. Rodriguez, C. M. Turnbull, S. A. Lewis, R. Graves, H. F. Hernandez, T. E. Valdovinos, W. Barnhart, M. E. Cai, R. J. Meyerand, M. Nickles, P. M. Suzuki, P. Harrison, A. Arosio, J. R. Yevenes, J. Harris, Y. Marles‐Wright, R. N. Gossuin, P. Muller, L. Gillis, A. E. Bartel, Y. Z. Deans, L. M. Wadghiri, X. Bernas, B. K. Yu, D. H. Rutt, X. Turnbull, J. He, B. Cai, Y. Zhong, A. V. Qin, H. Naumova, V. Reinecke, J. Yarnykh, C. Deem, C. E. Yuan, M. Murry, V. Campan, G. D. Lionetti, F. Aquaro, M. Forini, L. Matteucci, F. Vannucci, C. Chiuppesi, M. Di Cristofano, M. Faggioni, L. Maioli, E. Barile, M. Messina, A. Lombardi, M. Pucci, F. A. Pistello, B. Recchia, E. T. Iordanova, C. Ahrens, J. Song, C. Wang, S. Mo, X. Mu, X. Jiang, Z. Zhong, G. Zhao, Y. Zhou, F. Zhuo, L. Chen, T. Kong, J. Lu, T. Yang, X. Yu, K. Shi, H. S. Li, J. Kim, J. H. Woo, H. J. Lee, Y. Joo, H. Choi, W. K. Kim, S. J. Moon, K. Kim, C. M. Bernau, A. M. Lewis, M. S. Petelinsek, D. J. Reagan, V. B. Niles, E. Mattis, M. Meyerand, C. N. Suzuki, M. Svendsen, H. Wang, F. He, Y. Gao, S. C. Guo, L. J. Beeman, J. F. Mandarino, K. M. Georges, P. C. Bennett, J. M. Ulatowski, F. Kauppinen, C. Mickoleit, S. Jorke, D. S. Geimer, J. P. Maier, J. Muller, C. Demut, D. Grafe, J. H. Schuler, J. Clement, E. C. H. Liu, R. C. Cheng, S.‐H. Long, L. Yang, P.‐H. Wang, J. Cheng, D. Yang, H. Wu, A. W. S. Mao, S. M. Chan, D. Pereira, S. R. Moss, P. Williams, A. Murray, B. Taylor, X. Todorich, B. Zhang, W. E. Slagle‐Webb, J. R. Seaman, T. T. Connor, D. H. Li, C. D. C. Chung, S. V. Allen, F. M. Torti, J. G. Torti, C. Y. Cyster, F. M. Chen, E. C. Brodsky, M. C. Niemi, W. E. Nakamura, M. R. Seaman, P. S. Daws, T. B. Patrick, M. I. Rodrigues, S. K. Kettunen, A. A. Lyons, K. M. Neves, R. Brindle, R. Blakemore, D. Uebe, S. Schueler, M. Meriaux, B. Boucher, Y. Marty, S. Lalatonne, L. Preveral, C. T. Motte, F. Lefevre, F. Geffroy, M. Lethimonnier, D. Pean, G. Garcia, D. Adryanczyk‐Perrier, N. Pignol, T. Ginet, S. Orlando, E. Mannucci, G. Fantechi, S. Conti, A. Tambalo, C. Busato, L. Innocenti, R. Ghin, P. Bassi, F. Arosio, C. Orsini, M. Sangregorio, M. F. Corti, P. Casula, A. Marzola, A. Lascialfari, P. Sbarbati, M. D. Tartaj, S. Morales, T. Veintemillas‐Verdaguer, C. J. Gonzalez‐Carreno, K. Serna, C. Grunberg, B. M. Wawer, D. Tebo, Z. Schuler, X. Xiang, J. Yang, W. Xu, Z. Lai, J. Hu, L. Tian, Q. Geng, E. Fang, M. Erdal, Y. Demirbilek, O. Yeh, L. Akbal, D. Ruff, A. Bozkurt, Y. Cabuk, B. Senel, O. Gumuskaya, S. Algin, S. Colak, E. B. Esener, M. Denkbas, F. Boucher, S. Geffroy, E. Bellanger, G. Selingue, M. Adryanczyk‐Perrier, C. T. Pean, D. Lefevre, S. Ginet, D. E. Meriaux, R. Goldhawk, A. Rohani, N. Sengupta, F. S. Gelman, K. M. Prato, A. C. Jones, M. D. Pollard, B. Pagel, G. Wu, M. Warnock, C. Zaiss, M. Lin, Z. Chen, L. Zhou, D. Mu, R. Nanz, G. Tuura, Y. Delso, Y. Jia, K. Chen, Y. Geng, Y. Cheng, J. Li, H. Qiu, R. Huang, R. P. R. Krishnamoorthy, P. Nanga, H. Bagga, R. Hariharan, S. Reddy, M. Chen, Y. Jiang, B. Yuan, Z.‐X. Zhang, C. Jiang, X. Ye, C. Yuan, S. Wang, J. Kuddannaya, D. R. Zhang, Z. Arifin, P. Han, G. Walczak, J. W. M. Liu, P. C. M. Bulte, N. N. van Zijl, G. Yadav, K. W. Y. Song, M. T. Chan, M. T. McMahon, A. A. McMahon, J. Y. Gilad, P. Z. Zhou, J. W. M. Sun, J. Y. van Zijl, J. F. Zhou, D. A. Payen, R. J. Wilson, P. C. M. Traystman, N. van Zijl, A. X. McVicar, D. F. Li, M. Goncalves, S. O. Bellyou, M. A. M. Meakin, R. Prado, A. Bartha, Y. Sakata, T. Fushimi, Y. Okada, T. Arakawa, S. Kunieda, A. Minamiguchi, N. Kido, S. Sakashita, K. Miyamoto, B. Togashi, K. Joo, Y. S. Han, S.‐K. Choi, S. S. Lee, J. H. Ahn, S.‐G. Chang, S. H. Kang, C. Zhou, C. Su, L. Liu, J. Zhao, J. Jiang, S. Zhang, W. Li, J. Zhu, Y. S. Wang, S. S. Choi, S.‐K. Ahn, J. H. Lee, S. Zhou, C. G. Jiang, Y. Eberhart, H.‐Y. Zhang, Z. Heo, L. Wen, H. Blair, M. Qin, A. Lim, J. D. Quinones‐Hinojosa, P. B. Weingart, M. G. Barker, J. Pomper, P. C. M. Laterra, J. O. van Zijl, J. Blakeley, H. Zhou, H. Yu, T. Lou, X. Zou, Z. Jiang, Y. Huang, C. Du, L. Jiang, J. Ma, W. Zhu, Q. He, J. Rui, Z. Zhou, S. Wen, H. Jiang, Y. Lu, Y. Feng, D.‐H. Heo, J. Lee, C. Wen, X. Su, M. Zhou, S.‐Y. Wang, M. Li, J.‐Y. Chen, D.‐T. Zhou, C. Peng, Y.‐M. Zhang, M. Dai, X. Wang, C.‐F. Hong, Q. Chang, B. Li, H. Ma, H.‐Y. Xiang, Y. Heo, D.‐H. Zhang, S. Lee, R. C. Leigh, P. C. M. Koehler, J. van Zijl, J. Wang, H.‐K. Zhou, K. Jeong, J. Han, Y. S. Zhao, X. Ahn, Y. Ma, Y. Bai, X. Lin, T. Hong, E. M. Ma, J. Haacke, J. Zhou, M. Wang, P. C. M. Zhou, G. W. J. van Zijl, Y. K. Harston, N. Tee, T. W. Blockley, S. Okell, G. Thandeswaran, F. Shaya, M. Sheerin, S. Cellerini, P. Payne, M. Jezzard, J. Chappell, A. Kennedy, J. Tietze, I. K. Blicher, L. Mikkelsen, M. K. Ostergaard, S. A. Strother, M. J. Smith, R. J. Donahue, T. F. Harris, L. M. Cloughesy, P. L. Liau, A. Nghiemphu, W. B. Lai, B. M. Pope, R. J. Ellingson, R. M. Liau, J. P. Prins, D. Antonios, W. H. Li, W. B. Yong, A. Pope, P. L. Lai, B. M. Nghiemphu, K. Ellingson, A. Cai, D. R. Singh, R. P. R. Roalf, M. Nanga, H. Haris, R. Gur, K. Reddy, M. Cai, A. Haris, F. Singh, J. H. Kogan, H. Greenberg, J. A. Hariharan, R. Detre, F. Reddy, A. Kogan, C. Singh, M. Debrosse, K. Haris, R. P. Cai, H. Elliott, K. A. Reddy, R. P. R. Davis, S. Nanga, S. H. Das, P. N. Chen, J. R. Hadar, T. H. Pollard, R. T. Lucas, B. Shinohara, H. Litt, M. A. Hariharan, J. A. Elliott, D. R. Reddy, P. E. Nanga, H. Rupert, M. Hariharan, M. E. Quarmley, E. Calkins, K. Dress, M. A. Prabhakaran, P. J. Elliott, R. C. Moberg, R. E. Gur, B. I. Reddy, K. P. Turetsky, A. N. O'Grady, B. D. Dula, L. M. Lyttle, B. N. Thompson, B. A. Conrad, L. J. Box, S. McKeithan, F. Pawate, B. A. Bagnato, P. Landman, S. A. Newhouse, M. Smith, K. Nath, R. Singh, F. Crescenzi, G. Kogan, S. Verma, H. Reddy, E. R. Hariharan, R. Melhem, P. Reddy, S. Bagga, R. Pickup, D. Crescenzi, A. Martinez, K. Borthakur, A. D'Aquilla, G. Singh, J. A. Verma, J. Detre, J. Reddy, L. Pepin, M.‐A. Francelle, L. Carrillo‐de Sauvage, P. de Longprez, K. Gipchtein, J. Cambon, E. Valette, J. Brouillet, W. Flament, R. R. Ling, G. Regatte, A. Navon, S. Jerschow, A. J. R. Glyn‐Jones, R. Palmer, A. J. Agricola, T. L. Price, H. Vincent, A. J. Weinans, Y. H. Carr, H.‐K. Yang, J.‐S. Jeong, S. Suh, R. Brinkhof, V. Nizak, J. J. Khlebnikov, D. W. J. Prompers, D. B. F. Klomp, X. Saris, N. N. Xu, L. Yadav, J. Knutsson, R. Hua, E. Kalyani, J. Hall, J. Laterra, R. Blakeley, M. Strowd, P. Pomper, K. W. Y. Barker, G. Chan, M. T. Liu, R. D. McMahon, P. C. M. Stevens, K.‐P. Weygand, A. S. R. Hwang, Y. Mohamed, C. D. Ding, S. Y. Fuller, S. J. Lai, J. Frank, K. W. Y. Zhou, Y. McMahon, G. Kato, Z. M. Bulte, D. Bhujwalla, P. C. M. Artemov, S. van Zijl, R. Walker‐Samuel, F. Ramasawmy, M. Torrealdea, V. Rega, S. P. Rajkumar, S. Johnson, M. Richardson, H. G. Goncalves, E. Parkes, D. L. Arstad, R. B. Thomas, M. F. Pedley, X. Lythgoe, P. C. M. Golay, C. K. van Zijl, J. Jones, C. R. Ren, A. D. Malloy, C. O. Sherry, J. Miller, E. Y. Cao, B. M. Chekmenev, A. D. Damon, J. C. Cherrington, G. L. Gore, A. J. W. Simegn, F. C. Van der Kouwe, E. M. Robertson, A. Meintjes, M. Alhamud, R. Wyss, K. Kaddurah‐Daouk, R.‐W. Cai, X. J. Tain, F. C. Zhou, A. M. Damen, H. Scotti, H. Hariharan, R. Poptani, H. Singh, W. Poptani, H. Lu, X. J. Hariharan, R. Zhou, Z. Reddy, Y. Nguyen, J. L. Chen, Z. Shaw, E. Dawkins, D. Marbyn, C. Li, R. P. R. DeBrosse, N. Nanga, K. Wilson, M. D'Aquilla, F. Hariharan, K. Yan, N. Wade, D. Sara, C. Worsley, E. Parris‐Skeete, R. McCormick, Z. Z. Xiao, L. Cunningham, K. L. Fishbein, D. R. Nathanson, V. A. Lynch, M. Stallings, M. J. Yudkoff, R. Falk, S. E. Reddy, X.‐Y. McCormack, F. Xie, E. C. Wang, J. Lin, D. F. Xu, J. C. Gochberg, Z. Gore, S. Zu, A. A. Meier, J. A. Gilad, C. Brandon, E. Qian, J. F. Gao, M. Abisambra, M. J. Vandsburger, P. C. M. Donahue, S. Donahue, C. R. Rane, M. K. Thompson, A. O. Strother, S. A. Scott, Z. Smith, F. Hu, X. Huang, X. Guo, S. Quan, X. Zhou, Z. Zhao, F. Wen, S. Huang, X. Lu, D. Hu, J. Zu, K. Zhou, Z. Yan, C. Fu, K. Yang, D.‐H. Jiang, H.‐Y. Lee, R. N. Zhang, J. E. Cole, J. Van Eyk, J. Zaiss, S. Windschuh, D. Goerke, J.‐E. Paech, S. Meissner, P. Burth, W. Kickingereder, M. Wick, H.‐P. Bendszus, M. E. Schlemmer, P. Ladd, A. Bachert, C. K. Radbruch, M. J. Jones, P. C. M. Schlosser, M. G. van Zijl, X. Pomper, J. Golay, J. O. Zhou, M. Hua, M. G. Laterra, P. C. M. Pomper, M. Zhu, L. Lim, A. Blair, S. A. Quinones‐Hinojosa, C. G. Messina, M. G. Eberhart, P. B. Laterra, P. C. M. Barker, A. N. Blakeley, S. Dula, L. M. Pawate, B. N. Dethrage, B. E. Conrad, R. L. Dewey, S. A. Barry, A. N. Smith, E. M. Dula, B. A. Asche, E. B. Landman, S. Welch, S. Pawate, J. C. Sriram, S. A. Gore, J. A. Smith, J. M. Wells, H. E. O'Callaghan, N. M. Holmes, R. A. Powell, B. Johnson, F. Siow, O. Torrealdea, S. Ismail, X. Walker‐Samuel, M. Golay, S. Rega, M. J. Modat, S. Cardoso, A. J. Ourselin, Z. Schwarz, T. K. Ahmed, M. J. Murray, E. C. O'Neill, N. Collins, M. F. Colgan, J. Lythgoe, C. van Zijl, A. Schleich, L. Mueller‐Lutz, J. Zimmermann, B. Boos, H.‐J. Schmitt, G. Wittsack, F. Antoch, M. Miese, Q. Kim, M.‐P. Chan, K. M. C. Anthony, D. Cheung, P.‐L. Samartzis, C. Khong, M. Mueller‐Lutz, B. Eichner, F. Schmitt, B. Matuschke, C. Bittersohl, H.‐J. Zilkens, C. Miese, F. Mueller‐Lutz, P. Matuschke, R. Sewerin, B. Sengewein, B. Schmitt, H.‐J. Ostendorf, K. Wittsack, G. Stanke, R. P. R. Haris, A. Nanga, K. Singh, F. Cai, H. Kogan, M. Kogan, C. Cai, H. Nanga, J. J. Reddy, T. Chung, J. H. Jin, S.‐G. Lee, E. Kim, M. Rerich, A. Zaiss, M. E. Korzowski, F. Bachert, R. B. Kogan, E. K. Stafford, G. E. Englund, H. Gold, R. Reddy, D. Bammer, P. W. Le Bihan, P. E. Schaefer, R. G. Grant, L. Gonzalez, M. Zhang, Z. Tang, J. Min, X. Lei, N. M. Henderson, K. de Souza, S. F. Thomas, V. A. Riches, S. A. Morgan, D. P. Sohaib, C. C. Dearnaley, N. J. Parker, V. van As, R. Granata, O. Fusco, B. Catalano, F. Guarino, F. Granata, A. Tatangelo, M. Avallone, R. Piccirillo, F. Palaia, A. Izzo, P. Petrillo, L. S. Agre, M. King, W. B. Yasui, O. P. Guggino, Y. Ottersen, A. Fujiyoshi, S. Engel, I. Nielsen, A. Direito, M. A. Madeira, G. Brito, G. Soveral, G.‐Y. Tang, H. Tomita, A. J. Dorward, E. Yool, A. R. Smith, T. J. Townsend, J. E. Price, A. S. Hardingham, A. J. Verkman, P.‐w. Smith, L. Phuan, M. O. Tradtrantip, J. A. Anderson, J. I. Hubbard, D. K. Szu, E. A. Binder, O. P. Nagelhus, M. C. Ottersen, A. S. Papadopoulos, C. Verkman, E. Iacovetta, R. Rudloff, M. Kirby, G. Xiao, B. Hu, Y. Desai, B. Hsu, J. G. Schneller, A. I. Hobbs, A. Mehta, S. Linninger, M. C. Saadoun, A. M. Papadopoulos, J. Fukuda, H. Badaut, C. Chu, H. Huang, J. Ding, Z. Dong, X. Gao, Q. Tang, C. Dong, J. Mai, T. Li, T. Wang, Y.‐L. Lu, J. Lan, T. Zhao, S. Ma, Y.‐L. Li, X. Lan, J.‐C. Wang, X.‐C. Lou, B. Ma, V. Zhang, F. Gradinaru, J. Ramakrishnan, R. Mattis, I. Prakash, I. Diester, K. R. Goshen, K. Thompson, Y.‐W. Deisseroth, P. Shieh, P. Minguez, J. J. Bork, D. L. Auburger, G. Guilbride, B. Kramer, E. Bukau, J. N. Natan, S. A. Wells, J. A. Teichmann, A. Marsh, H. C. Mukherjee, P. Davis, G. J. Ramesh, M. G. Lu, Y. Shapiro, B. W. Wang, E. J. Roose, V. Palovcak, I. J. Carnevale, J. P. F. Dmochowski, K. Werner, Y. Mishra, P. Huang, S. Vetschera, A. Glasl, K. Chmyrov, V. Richter, A. C. Ntziachristos, P. Stiel, K. Vetschera, J. P. Mishra, A. Fuenzalida‐Werner, V. Chmyrov, K. Stiel, K. Ono, K. Fuma, M. Tabata, H. S. Sawada, H. R. Kim, S. H. Cho, J. S. Choi, W. K. Woo, Y. Moon, H. S. Choi, K.‐W. Kim, K.‐M. Cho, Y. J. Lee, S.‐J. Yi, H. J. Eun, S. H. Woo, T.‐K. Choi, C. Whangbo, D.‐Y. Choi, W. K. Noh, S. Moon, R. Cheng, Y. Mi, G. Xu, J. Jin, Y. Zhang, F. Chen, C. Liu, D. Jiang, E. M. Wu, B. Haacke, H. Cohen, G. Dafni, A. Meir, M. Harmelin, M.‐R. Neeman, A. Lisy, C. Hartung, D. Lang, W. Schueler, J. R. Richter, W. A. Reichenbach, I. Kaiser, A. Hilger, Y. Bar‐Shir, K. W. Y. Liang, A. A. Chan, J. W. M. Gilad, D. I. Bulte, A. Piraner, H. C. Farhadi, D. Davis, D. Wu, J. O. Maresca, M. G. Szablowski, G. Farhadi, M. Ho, B. Kunth, A. Ling, R. W. Lu, L. Bourdeau, M. G. Schroeder, G. J. Shapiro, A. Farhadi, M. G. Mukherjee, J. O. Farhadi, S. R. Lee‐Gosselin, A. Barnes, R. W. Lakshmanan, M. Shapiro, E. Bekiesinska‐Figatowska, K. Sawicka, O. Zak, J. Szczygielski, L. Stritzker, M. Kirscher, N. C. Scadeng, S. Deliolanis, P. Morscher, K. Symvoulidis, Q. Schaefer, M. Buckel, U. Hess, W. G. Donat, V. Bradley, A. A. Ntziachristos, T. Szalay, A. Repenko, A. Rix, J. Nedilko, A. Rose, R. Hermann, S. Vinokur, R. Moli, M. Cao‐Milan, G. Mayer, A. von Plessen, L. Fery, W. De Laporte, D. N. Lederle, A. J. C. Chigrin, J. E. Kuehne, Z. Lemaster, A. Wang, F. Hariri, Y. Hu, C. V. Huang, R. Barback, N. C. Cochran, J. V. Gianneschi, R. J. Jokerst, A. E. Paproski, K. Forbrich, M. M. Wachowicz, R. J. Hitt, A. Zemp, F. Farhadi, G. G. Sigmund, M. G. Westmeyer Show less
Abstract Imaging contrast agents are widely investigated in preclinical and clinical studies, among which biogenic imaging contrast agents (BICAs) are developing rapidly and playing an increasingly i Show more
Abstract Imaging contrast agents are widely investigated in preclinical and clinical studies, among which biogenic imaging contrast agents (BICAs) are developing rapidly and playing an increasingly important role in biomedical research ranging from subcellular level to individual level. The unique properties of BICAs, including expression by cells as reporters and specific genetic modification, facilitate various in vitro and in vivo studies, such as quantification of gene expression, observation of protein interactions, visualization of cellular proliferation, monitoring of metabolism, and detection of dysfunctions. Furthermore, in human body, BICAs are remarkably helpful for disease diagnosis when the dysregulation of these agents occurs and can be detected through imaging techniques. There are various BICAs matched with a set of imaging techniques, including fluorescent proteins for fluorescence imaging, gas vesicles for ultrasound imaging, and ferritin for magnetic resonance imaging. In addition, bimodal and multimodal imaging can be realized through combining the functions of different BICAs, which helps overcome the limitations of monomodal imaging. In this review, the focus is on the properties, mechanisms, applications, and future directions of BICAs. Show less
📄 PDF DOI: 10.1002/advs.202207090
Fe amino-acid imaging review
S. Trapotsi, G. Drakakis, A. Koutsoukas +1688 more · 2022 · RSC Chemical Biology · Royal Society of Chemistry · added 2026-04-20
S. Trapotsi, G. Drakakis, A. Koutsoukas, I. Cortes–Ciriano, P. MartĂ­nez–Alonso, T. E. Malliavin, A. Velazquez-Campoy, S. C. Brewerton, M. J. Bodkin, D. A. Evans, R. C. Glen, J. A. Carrodeguas, A. Bender, S. W. Page, J. E. Maddison, M. R. Trusheim, E. R. Berndt, F. L. Douglas, L. Rovin, C. J. Bailey, G. Zhou, R. Myers, Y. Li, Y. Chen, X. Shen, J. Fenyk-Melody, M. Wu, J. Ventre, T. Doebber, N. Fujii, N. Musi, M. F. Hirshman, L. J. Goodyear, D. E. Moller, I. Bezprozvanny, J. Wu, Q. Li, A. C. Lai, C. M. Crews, J. Downward, F. Ardito, M. Giuliani, D. Perrone, G. Troiano, L. L. Muzio, H. Lodish, A. Berk, S. L. Zipursky, P. Matsudaira, D. Baltimore, J. Darnell, N. Ammeux, B. E. Housden, A. Georgiadis, Y. Hu, N. Perrimon, J. E. Dumont, S. Dremier, I. Pirson, C. Maenhaut, T. Vu, F. X. Claret, H. S. Camp, O. Li, S. C. Wise, Y. H. Hong, C. L. Frankowski, R. Vanbogelen, T. Leff, K. Kores, J. Konc, U. Bren, M.-A. Trapotsi, L. H. Mervin, A. M. Afzal, N. Sturm, O. Engkvist, I. P. Barrett, B. Baillif, J. Wichard, O. MĂ©ndez-Lucio, D. RouquiĂ©, J. Inglese, D. S. Auld, B. A. Wetmore, J. F. Wambaugh, S. S. Ferguson, M. A. Sochaski, D. M. Rotroff, K. Freeman, H. J. Clewell III, D. J. Dix, M. E. Andersen, K. A. Houck, B. Allen, R. S. Judson, R. Singh, R. J. Kavlock, A. M. Richard, R. S. Thomas, M. Schenone, V. Dančík, B. K. Wagner, P. A. Clemons, A. Subramanian, R. Narayan, S. M. Corsello, D. D. Peck, T. E. Natoli, X. Lu, J. Gould, J. F. Davis, A. A. Tubelli, J. K. Asiedu, D. L. Lahr, J. E. Hirschman, Z. Liu, M. Donahue, B. Julian, M. Khan, D. Wadden, I. C. Smith, D. Lam, A. Liberzon, C. Toder, M. Bagul, M. Orzechowski, O. M. Enache, F. Piccioni, S. A. Johnson, N. J. Lyons, A. H. Berger, A. F. Shamji, A. N. Brooks, A. Vrcic, C. Flynn, J. Rosains, D. Y. Takeda, R. Hu, D. Davison, J. Lamb, K. Ardlie, L. Hogstrom, P. Greenside, N. S. Gray, S. Silver, X. Wu, W.-N. Zhao, W. Read-Button, S. J. Haggarty, L. V. Ronco, J. S. Boehm, S. L. Schreiber, J. G. Doench, J. A. Bittker, D. E. Root, B. Wong, T. R. Golub, J. M. Raser, E. K. O’Shea, A. A. Kalaitzis, N. D. Lawrence, D. P. Nusinow, J. Szpyt, M. Ghandi, C. M. Rose, E. R. McDonald, M. Kalocsay, J. JanĂ©-Valbuena, E. Gelfand, D. K. Schweppe, M. Jedrychowski, J. Golji, D. A. Porter, T. Rejtar, Y. K. Wang, G. V. Kryukov, F. Stegmeier, B. K. Erickson, L. A. Garraway, W. R. Sellers, S. P. Gygi, M.-A. Bray, S. Singh, H. Han, C. T. Davis, B. Borgeson, C. Hartland, M. Kost-Alimova, S. M. Gustafsdottir, C. C. Gibson, A. E. Carpenter, A. X. Lu, O. Z. Kraus, S. Cooper, A. M. Moses, S. N. Chandrasekaran, H. Ceulemans, J. D. Boyd, M. J. Cox, S. Jaensch, J. Van de Waeter, L. Cougnaud, D. Seynaeve, S. Benalla, S. J. Koo, I. Van Den Wyngaert, J.-M. Neefs, D. Malkov, M. Bittremieux, M. Steemans, P. J. Peeters, J. K. Wegner, E. Gustin, Y. T. Chong, H. W. H. Göhlmann, I. Nassiri, M. N. McCall, P. D. Piehowski, V. A. Petyuk, D. J. Orton, F. Xie, M. Ramirez-Restrepo, A. Engel, A. P. Lieberman, R. L. Albin, D. G. Camp, R. D. Smith, A. J. Myers, M. Medo, D. M. Aebersold, M. MedovĂĄ, C. H. Johnson, F. J. Gonzalez, T. Ramirez, M. Daneshian, H. Kamp, F. Y. Bois, M. R. Clench, M. Coen, B. Donley, S. M. Fischer, D. R. Ekman, E. Fabian, C. Guillou, J. Heuer, H. T. Hogberg, H. Jungnickel, H. C. Keun, G. Krennrich, E. Krupp, A. Luch, F. Noor, E. Peter, B. Riefke, M. Seymour, N. Skinner, L. Smirnova, E. Verheij, S. Wagner, T. Hartung, B. van Ravenzwaay, M. Leist, A. M. D. Livera, M. Sysi-Aho, L. Jacob, J. A. Gagnon-Bartsch, S. Castillo, J. A. Simpson, T. P. Speed, R. Chaleckis, I. Meister, P. Zhang, C. E. Wheelock, J. G. Abelin, J. Patel, C. M. Feeney, L. Fagbami, A. L. Creech, L. Pino, J. W. Qiao, E. Kuhn, A. Officer, J. Li, S. Abbatiello, R. Sidman, E. Snyder, S. A. Carr, J. D. Jaffe, Y. A. Chen, S. A. Eschrich, L. Litichevskiy, R. Peckner, C. M. Dunning, J. D. Egertson, S. Egri, T. Ko, B. X. MacLean, A. E. Mungenast, M. Papanastasiou, V. Sharma, J. Z. Young, M. J. MacCoss, L.-H. Tsai, R. Lewis, Z. Tanoli, U. Seemab, A. Scherer, K. Wennerberg, J. Tang, M. VĂ€hĂ€-Koskela, A. Gaulton, L. J. Bellis, A. P. Bento, J. Chambers, M. Davies, A. Hersey, Y. Light, S. McGlinchey, D. Michalovich, B. Al-Lazikani, J. P. Overington, S. Kim, J. Chen, T. Cheng, A. Gindulyte, J. He, S. He, B. A. Shoemaker, P. A. Thiessen, B. Yu, L. Zaslavsky, J. Zhang, E. E. Bolton, I. A. Smit, C. H. G. Allen, F. Svensson, T. Hanser, J. Bajorath, J. Sun, N. Jeliazkova, V. Chupakhin, J.-F. Golib-Dzib, L. Carlsson, J. Wegner, I. Georgiev, V. Jeliazkov, N. Kochev, T. J. Ashby, H. Chen, T. Kalliokoski, C. Kramer, A. Vulpetti, P. Gedeck, A. Lin, D. Horvath, V. Afonina, G. Marcou, J.-L. Reymond, A. Varnek, C. Ye, D. J. Ho, M. Neri, C. Yang, T. Kulkarni, R. Randhawa, M. Henault, N. Mostacci, P. Farmer, S. Renner, R. Ihry, L. Mansur, C. G. Keller, G. McAllister, M. Hild, J. Jenkins, A. Kaykas, P. R. Bushel, R. S. Paules, S. S. Auerbach, H. K. Yalamanchili, Y.-W. Wan, G. X. Y. Zheng, J. M. Terry, P. Belgrader, P. Ryvkin, Z. W. Bent, R. Wilson, S. B. Ziraldo, T. D. Wheeler, G. P. McDermott, J. Zhu, M. T. Gregory, J. Shuga, L. Montesclaros, J. G. Underwood, D. A. Masquelier, S. Y. Nishimura, M. Schnall-Levin, P. W. Wyatt, C. M. Hindson, R. Bharadwaj, A. Wong, K. D. Ness, L. W. Beppu, H. J. Deeg, C. McFarland, K. R. Loeb, W. J. Valente, N. G. Ericson, E. A. Stevens, J. P. Radich, T. S. Mikkelsen, B. J. Hindson, J. H. Bielas, N. J. Schurch, P. Schofield, M. GierliƄski, C. Cole, A. Sherstnev, V. Singh, N. Wrobel, K. Gharbi, G. G. Simpson, T. Owen-Hughes, M. Blaxter, G. J. Barton, A. Koussounadis, S. P. Langdon, I. H. Um, D. J. Harrison, V. A. Smith, X. Xie, E. D. Crawford, D. Peck, J. W. Modell, I. C. Blat, M. J. Wrobel, J. Lerner, J.-P. Brunet, K. N. Ross, M. Reich, H. Hieronymus, G. Wei, S. A. Armstrong, R. Wei, E. S. Lander, R. Edgar, M. Domrachev, A. E. Lash, H. Parkinson, M. Kapushesky, M. Shojatalab, N. Abeygunawardena, R. Coulson, A. Farne, E. Holloway, N. Kolesnykov, P. Lilja, M. Lukk, R. Mani, T. Rayner, A. Sharma, E. William, U. Sarkans, A. Brazma, D. L. Svoboda, T. Saddler, Y. Igarashi, N. Nakatsu, T. Yamashita, A. Ono, Y. Ohno, T. Urushidani, H. Yamada, N. Lim, P. Pavlidis, A. Musa, L. S. Ghoraie, S.-D. Zhang, G. Galzko, O. Yli-Harja, M. Dehmer, B. Haibe-Kains, F. Emmert-Streib, M. Bickle, S. Seal, H. Yang, L. Vollmers, T. R. Jones, M. R. Lamprecht, C. Clarke, I. H. Kang, O. Friman, D. A. Guertin, J. H. Chang, R. A. Lindquist, J. Moffat, P. Golland, D. M. Sabatini, M. Held, M. H. A. Schmitz, B. Fischer, T. Walter, B. Neumann, M. H. Olma, M. Peter, J. Ellenberg, D. W. Gerlich, S. Rajaram, B. Pavie, L. F. Wu, S. J. Altschuler, J. Ollion, J. Cochennec, F. Loll, C. EscudĂ©, T. Boudier, T. Wollmann, M. Gunkel, I. Chung, H. Erfle, K. Rippe, K. Rohr, J. C. Caicedo, A. Goodman, K. W. Karhohs, B. A. Cimini, J. Ackerman, M. Haghighi, C. Heng, T. Becker, M. Doan, C. McQuin, M. Rohban, V. Chernyshev, L. Kamentsky, L. Ding, S. M. Rafelski, D. Thirstrup, W. Wiegraebe, F. Heigwer, S. Warchal, P. Qiu, C. Molnar, A. S. Vasilevich, J. D. Barry, H. S. Bansal, O. Kraus, M. Wawer, L. Paavolainen, M. D. Herrmann, J. Hung, H. Hennig, J. Concannon, I. Smith, P. Rees, P. Horvath, R. G. Linington, V. Ljosa, K. L. Sokolnicki, E. Williams, J. Moore, S. W. Li, G. Rustici, A. Tarkowska, A. Chessel, S. Leo, B. Antal, R. K. Ferguson, R. E. C. Salas, J. R. Swedlow, M. H. Rohban, N. E. Bodycombe, T. P. Hasaka, C. S. Hon, M. M. Kemp, K. Li, D. Walpita, M. J. Wawer, A. Mullard, A. A. Saei, C. M. Beusch, A. Chernobrovkin, P. Sabatier, B. Zhang, Ü. G. Tokat, E. Stergiou, M. Gaetani, Á. VĂ©gvĂĄri, R. A. Zubarev, M. Zapalska-Sozoniuk, L. Chrobak, K. Kowalczyk, M. Kankofer, H. Gullberg, K. Johansson, B. Lundgren, P. I. Arvidsson, E. S. J. ArnĂ©r, Y. Perez-Riverol, A. Csordas, J. Bai, M. Bernal-Llinares, S. Hewapathirana, D. J. Kundu, A. Inuganti, J. Griss, G. Mayer, M. Eisenacher, E. PĂ©rez, J. Uszkoreit, J. Pfeuffer, T. Sachsenberg, ƞ. Yılmaz, S. Tiwary, J. Cox, E. Audain, M. Walzer, A. F. Jarnuczak, T. Ternent, J. A. VizcaĂ­no, P. Samaras, T. Schmidt, M. Frejno, S. Gessulat, M. Reinecke, A. Jarzab, J. Zecha, J. Mergner, P. Giansanti, H.-C. Ehrlich, S. Aiche, J. Rank, H. Kienegger, H. Krcmar, B. Kuster, M. Wilhelm, B. Aslam, M. Basit, M. A. Nisar, M. Khurshid, M. H. Rasool, Y. Lao, X. Wang, N. Xu, H. Zhang, H. Xu, K. Hollywood, D. R. Brison, R. Goodacre, L. Zhang, C. Ma, H. Chao, Y. Long, Z. Li, X. Ge, H. Xia, Y. Yin, J. Batley, M. Li, R. Cavill, D. Jennen, J. Kleinjans, J. J. BriedĂ©, W. Lu, X. Su, M. S. Klein, I. A. Lewis, O. Fiehn, J. D. Rabinowitz, M. Wright Muelas, I. Roberts, F. Mughal, S. O’Hagan, P. J. Day, D. B. Kell, Y. Lin, G. W. Caldwell, W. Lang, J. Masucci, K. Peters, J. Bradbury, S. Bergmann, M. Capuccini, M. Cascante, P. de Atauri, T. M. D. Ebbels, C. Foguet, R. Glen, A. Gonzalez-Beltran, U. L. GĂŒnther, E. Handakas, T. Hankemeier, K. Haug, S. Herman, P. Holub, M. Izzo, D. Jacob, D. Johnson, F. Jourdan, N. Kale, I. Karaman, B. Khalili, P. Emami Khonsari, K. Kultima, S. Lampa, A. Larsson, C. Ludwig, P. Moreno, S. Neumann, J. A. Novella, C. O’Donovan, J. T. M. Pearce, A. Peluso, M. E. Piras, L. Pireddu, M. A. C. Reed, P. Rocca-Serra, P. Roger, A. Rosato, R. Rueedi, C. Ruttkies, N. Sadawi, R. M. Salek, S.-A. Sansone, V. Selivanov, O. Spjuth, D. Schober, E. A. ThĂ©venot, M. Tomasoni, M. van Rijswijk, M. van Vliet, M. R. Viant, R. J. M. Weber, G. Zanetti, C. Steinbeck, J. Xia, N. Psychogios, N. Young, D. S. Wishart, K. Cochrane, V. C. Nainala, M. Williams, J. Chang, K. V. Jayaseelan, A. I. Campos, M. Zampieri, T. Fuhrer, D. C. SĂ©vin, U. Sauer, N. Zamboni, N. J. Shah, S. Sureshkumar, D. G. Shewade, P. V. Hornbeck, J. M. Kornhauser, S. Tkachev, E. Skrzypek, B. Murray, V. Latham, M. Sullivan, T. Y. Low, M. A. Mohtar, P. Y. Lee, N. Omar, H. Zhou, M. Ye, M. K. Morris, A. Chi, I. N. Melas, L. G. Alexopoulos, M. L. Guerriero, A. Corrigan, A. Bornot, M. Firth, P. O’Shea, D. Ross-Thriepland, S. Peel, A. Agrotis, R. Ketteler, M. Jost, J. S. Weissman, E. Goncalves, C. Fellmann, B. G. Gowen, P.-C. Lin, J. A. Doudna, J. E. Corn, S. M. B. Nijman, A. E. Enayetallah, D. Ziemek, M. T. Leininger, J. Yang, T. B. Manion, D. E. Mather, W. J. Zavadoski, M. Kuhn, J. L. Treadway, S. A. G. des Etages, E. M. Gibbs, N. Greene, C. M. Steppan, R. Kumar, S. J. Blakemore, C. E. Ellis, E. F. Petricoin, D. Pratt, M. Macoritto, A. L. Matthews, J. J. Loureiro, K. Elliston, R. T. Pillich, V. Rynkov, D. Welker, S. Orchard, S. Kerrien, S. Abbani, B. Aranda, J. Bhate, S. Bidwell, A. Bridge, L. Briganti, F. S. L. Brinkman, G. Cesareni, A. Chatr-aryamontri, E. Chautard, C. Chen, M. Dumousseau, J. Goll, R. E. W. Hancock, L. I. Hannick, I. Jurisica, J. Khadake, D. J. Lynn, U. Mahadevan, L. Perfetto, A. Raghunath, S. Ricard-Blum, B. Roechert, L. Salwinski, V. StĂŒmpflen, M. Tyers, P. Uetz, I. Xenarios, H. Hermjakob, M. D. Wilkinson, M. Dumontier, I. J. J. Aalbersberg, G. Appleton, M. Axton, A. Baak, N. Blomberg, J.-W. Boiten, L. B. da Silva Santos, P. E. Bourne, J. Bouwman, A. J. Brookes, T. Clark, M. Crosas, I. Dillo, O. Dumon, S. Edmunds, C. T. Evelo, R. Finkers, A. J. G. Gray, P. Groth, C. Goble, J. S. Grethe, J. Heringa, P. A. C.’t Hoen, R. Hooft, T. Kuhn, R. Kok, J. Kok, S. J. Lusher, M. E. Martone, A. Mons, A. L. Packer, B. Persson, M. Roos, R. van Schaik, E. Schultes, T. Sengstag, T. Slater, G. Strawn, M. A. Swertz, M. Thompson, J. van der Lei, E. van Mulligen, J. Velterop, A. Waagmeester, P. Wittenburg, K. Wolstencroft, J. Zhao, B. Mons, C. von Mering, L. J. Jensen, B. Snel, S. D. Hooper, M. Krupp, M. Foglierini, N. Jouffre, M. A. Huynen, P. Bork, L. Garcia-Alonso, M. M. Ibrahim, D. Turei, J. Saez-Rodriguez, H. Huang, B. M. Jedynak, J. S. Bader, X. Zhu, M. Gerstein, M. Snyder, K. Luck, D.-K. Kim, L. Lambourne, K. Spirohn, B. E. Begg, W. Bian, R. Brignall, T. Cafarelli, F. J. Campos-Laborie, B. Charloteaux, D. Choi, A. G. CotĂ©, M. Daley, S. Deimling, A. Desbuleux, A. Dricot, M. Gebbia, M. F. Hardy, N. Kishore, J. J. Knapp, I. A. KovĂĄcs, I. Lemmens, M. W. Mee, J. C. Mellor, C. Pollis, C. Pons, A. D. Richardson, S. Schlabach, B. Teeking, A. Yadav, M. Babor, D. Balcha, O. Basha, C. Bowman-Colin, S.-F. Chin, S. G. Choi, C. Colabella, G. Coppin, C. D’Amata, D. De Ridder, S. De Rouck, M. Duran-Frigola, H. Ennajdaoui, F. Goebels, L. Goehring, A. Gopal, G. Haddad, E. Hatchi, M. Helmy, Y. Jacob, Y. Kassa, S. Landini, R. Li, N. van Lieshout, A. MacWilliams, D. Markey, J. N. Paulson, S. Rangarajan, J. Rasla, A. Rayhan, T. Rolland, A. San-Miguel, Y. Shen, D. Sheykhkarimli, G. M. Sheynkman, E. Simonovsky, M. Taßan, A. Tejeda, V. Tropepe, J.-C. Twizere, Y. Wang, R. J. Weatheritt, J. Weile, Y. Xia, X. Yang, E. Yeger-Lotem, Q. Zhong, P. Aloy, G. D. Bader, J. De Las Rivas, S. Gaudet, T. Hao, J. Rak, J. Tavernier, D. E. Hill, M. Vidal, F. P. Roth, M. A. Calderwood, S. Bazzani, K. Sriyudthsak, F. Shiraishi, M. Y. Hirai, E. Alm, A. P. Arkin, J. Ma, A. Shojaie, G. Michailidis, S. Chowdhury, R. R. Sarkar, G. Vert, J. Chory, W. A. Haynes, A. Tomczak, P. Khatri, T. Charitou, K. Bryan, A. BrĂŒckner, C. Polge, N. Lentze, D. Auerbach, U. Schlattner, B. Tian, C. Zhao, F. Gu, Z. He, R. Krause, M. Cornell, S. G. Oliver, S. Fields, D. Voet, J. G. Voet, A. R. Neves, A. Ramos, M. C. Nunes, M. Kleerebezem, J. Hugenholtz, W. M. de Vos, J. Almeida, H. Santos, S. A. Lambert, A. Jolma, L. F. Campitelli, P. K. Das, M. Albu, X. Chen, J. Taipale, T. R. Hughes, M. T. Weirauch, P. J. Park, A. Blais, B. D. Dynlacht, M. Haque, R. Sarmah, D. K. Bhattacharyya, P. J. Thul, C. Lindskog, R. Barshir, M. Sharon, E. Lerman, B. F. Kirson, I. Hekselman, J. K. Huang, D. E. Carlin, M. K. Yu, W. Zhang, J. F. Kreisberg, P. Tamayo, T. Ideker, D. Yu, M. Kim, G. Xiao, T. H. Hwang, C. H. Wu, N. C. Duarte, S. A. Becker, N. Jamshidi, I. Thiele, M. L. Mo, T. D. Vo, R. Srivas, B. Ø. Palsson, D. TĂŒrei, T. KorcsmĂĄros, R. Oughtred, J. Rust, C. Chang, B. Breitkreutz, C. Stark, A. Willems, L. Boucher, G. Leung, N. Kolas, F. Zhang, S. Dolma, J. Coulombe-Huntington, K. Dolinski, E. L. Huttlin, L. Ting, R. J. Bruckner, F. Gebreab, M. P. Gygi, S. Tam, G. Zarraga, G. Colby, K. Baltier, R. Dong, V. Guarani, L. P. Vaites, A. Ordureau, R. Rad, M. WĂŒhr, J. Chick, B. Zhai, D. Kolippakkam, J. Mintseris, R. A. Obar, T. Harris, S. Artavanis-Tsakonas, M. E. Sowa, P. DeCamilli, J. A. Paulo, J. W. Harper, R. Goel, H. C. Harsha, A. Pandey, T. S. K. Prasad, C. S. Greene, A. Krishnan, A. K. Wong, E. Ricciotti, R. A. Zelaya, D. S. Himmelstein, R. Zhang, B. M. Hartmann, E. Zaslavsky, S. C. Sealfon, D. I. Chasman, G. A. FitzGerald, T. Grosser, O. G. Troyanskaya, J. J. O’Shea, D. M. Schwartz, A. V. Villarino, M. Gadina, I. B. McInnes, A. Laurence, S. A. Sam, J. Teel, A. N. Tegge, A. Bharadwaj, T. M. Murali, A. Fabregat, S. Jupe, L. Matthews, K. Sidiropoulos, M. Gillespie, P. Garapati, R. Haw, B. Jassal, F. Korninger, B. May, M. Milacic, C. D. Roca, K. Rothfels, C. Sevilla, V. Shamovsky, S. Shorser, T. Varusai, G. Viteri, J. Weiser, G. Wu, L. Stein, P. D’Eustachio, D. N. Slenter, M. Kutmon, K. Hanspers, A. Riutta, J. Windsor, N. Nunes, J. MĂ©lius, E. Cirillo, S. L. Coort, D. Digles, F. Ehrhart, P. Giesbertz, M. Kalafati, M. Martens, R. Miller, K. Nishida, L. Rieswijk, L. M. T. Eijssen, A. R. Pico, E. L. Willighagen, M. Kanehisa, S. Goto, M. Trupp, T. Altman, C. A. Fulcher, R. Caspi, M. Krummenacker, S. Paley, P. D. Karp, E. G. Cerami, B. E. Gross, E. Demir, I. Rodchenkov, Ö. Babur, N. Anwar, N. Schultz, C. Sander, L. Y. Geer, A. Marchler-Bauer, R. C. Geer, L. Han, C. Liu, W. Shi, S. H. Bryant, S. G. Jantzen, B. J. Sutherland, D. R. Minkley, B. F. Koop, F. Supek, M. BoĆĄnjak, N. Ć kunca, T. Ć muc, D. V. Klopfenstein, B. S. Pedersen, F. RamĂ­rez, A. Warwick Vesztrocy, A. Naldi, C. J. Mungall, J. M. Yunes, O. Botvinnik, M. Weigel, W. Dampier, C. Dessimoz, P. Flick, H. Tang, D. Domingo-FernĂĄndez, S. Mubeen, J. MarĂ­n-LlaĂł, C. T. Hoyt, M. Hofmann-Apitius, A. B. Keenan, M. L. Wojciechowicz, Z. Wang, K. M. Jagodnik, S. L. Jenkins, A. Lachmann, A. Ma’ayan, X. P. Peng, C. Clement, A. Rodina, M. Nieto, J. Du, K. Stegmaier, S. M. Raj, K. N. Maloney, J. Clardy, W. C. Hahn, G. Chiosis, I. Barrett, P. Shannon, T. Sandmann, S. K. Kummerfeld, R. Gentleman, R. Bourgon, M. A. GarcĂ­a-Campos, J. Espinal-EnrĂ­quez, E. HernĂĄndez-Lemus, A. Yuryev, S. Ekins, R. Mathur, D. Rotroff, A. Motsinger-Reif, M. Sirota, A. J. Butte, B. Debrabant, M. E. Ritchie, B. Phipson, D. Wu, C. W. Law, G. K. Smyth, E. Lim, F. Vaillant, M.-L. Asselin-Labat, J. E. Visvader, P. D. Thomas, M. J. Campbell, A. Kejariwal, H. Mi, B. Karlak, R. Daverman, K. Diemer, A. Muruganujan, A. Narechania, E. Y. Chen, C. M. Tan, Y. Kou, Q. Duan, G. V. Meirelles, N. R. Clark, G. Dennis, B. T. Sherman, D. A. Hosack, W. Gao, H. C. Lane, R. A. Lempicki, A. Markiel, O. Ozier, N. S. Baliga, J. T. Wang, D. Ramage, N. Amin, B. Schwikowski, G. Bindea, B. Mlecnik, H. Hackl, P. Charoentong, M. Tosolini, A. Kirilovsky, W.-H. Fridman, F. PagĂšs, Z. Trajanoski, J. Galon, G. Yu, Q.-Y. He, L.-G. Wang, Y. Han, I. Ihnatova, E. Budinska, F. Li, Y. Qin, X. Bo, Y. Wu, S. Wang, G. Bradley, S. J. Barrett, N. L. Catlett, A. J. Bargnesi, S. Ungerer, T. Seagaran, W. Ladd, K. O. Elliston, S. Jaeger, J. Min, F. Nigsch, M. Camargo, J. Hutz, A. Cornett, S. Cleaver, A. Buckler, J. L. Jenkins, J. H. Woo, Y. Shimoni, W. S. Yang, P. Subramaniam, A. Iyer, P. Nicoletti, M. RodrĂ­guez MartĂ­nez, G. LĂłpez, M. Mattioli, R. Realubit, C. Karan, B. R. Stockwell, M. Bansal, A. Califano, H. Noh, J. E. Shoemaker, R. Gunawan, A. Liu, P. Trairatphisan, E. Gjerga, A. Didangelos, J. Barratt, A. Dugourd, C. Kuppe, M. Sciacovelli, K. B. Emdal, D. B. Bekker-Jensen, J. Kranz, E. M. J. Bindels, A. S. H. Costa, J. V. Olsen, C. Frezza, R. Kramann, A. Dubovenko, Y. Nikolsky, E. Rakhmatulin, T. Nikolskaya, A. KrĂ€mer, J. Green, J. Pollard, S. Tugendreich, C. Wiwie, J. Baumbach, R. Röttger, M. R. Karim, O. Beyan, A. Zappa, I. G. Costa, D. Rebholz-Schuhmann, M. Cochez, S. Decker, D. Xu, Y. Tian, F. Pedregosa, G. Varoquaux, A. Gramfort, V. Michel, B. Thirion, O. Grisel, M. Blondel, P. Prettenhofer, R. Weiss, V. Dubourg, J. Vanderplas, A. Passos, D. Cournapeau, M. MĂ€chler, P. Rousseeuw, A. Struyf, M. Hubert, K. Hornik, A. Kassambara, F. Mundt, R. Argelaguet, B. Velten, D. Arnol, S. Dietrich, T. Zenz, J. C. Marioni, F. Buettner, W. Huber, O. Stegle, A. Klami, S. Virtanen, E. LeppĂ€aho, S. Kaski, S. A. Khan, O. P. Kallioniemi, A. Poso, T. Chen, S. Tyagi, D. Bredikhin, Y. Deloro, E. Leppaaho, M. Ammad-ud-din, I. Subramanian, S. Verma, S. Kumar, A. Jere, K. Anamika, R. Chen, X. Liu, S. Jin, J. Lin, J. Liu, J. Vamathevan, D. Clark, P. Czodrowski, I. Dunham, E. Ferran, G. Lee, B. Li, A. Madabhushi, P. Shah, M. Spitzer, S. Zhao, J. Scheiber, M. Glick, J. W. Davies, K. Azzaoui, J. Hamon, L. Urban, S. Whitebread, D. Rogers, M. Hahn, Y. C. Martin, J. L. Kofron, L. M. Traphagen, S. Gao, D. Luo, G. Liu, Z. Xiao, G. Shan, Y. Zhang, W. Zhou, C. Scheeder, M. Boutros, R. P. Sheridan, L. M. Kauvar, D. L. Higgins, H. O. Villar, J. R. Sportsman, A. Engqvist-Goldstein, R. Bukar, K. E. Bauer, H. Dilley, D. M. Rocke, C. Yuan, T. V. Aa, I. Chakroun, J. Simm, A. Arany, Y. Moreau, T. L. Van, J. F. G. Dzib, R. Wuyts, W. Verachtert, M. Wen, Z. Zhang, S. Niu, H. Sha, R. Yang, Y. Yun, H. Lu, A. A. M. Al-Saffar, H. Tao, M. A. Talab, A. Mayr, G. Klambauer, T. Unterthiner, M. Steijaert, D.-A. Clevert, S. Hochreiter, M. C. Robinson, A. A. Lee, I. CortĂ©s-Ciriano, Y. Zhu, T. Brettin, F. Xia, A. Partin, M. Shukla, H. Yoo, Y. A. Evrard, J. H. Doroshow, R. L. Stevens, M. Hofmarcher, E. Rumetshofer, N. Aniceto, A. A. Freitas, T. Ghafourian, N. Bosc, F. Atkinson, E. Felix, A. R. Leach, Y. Saeys, I. Inza, P. Larrañaga, R. Caruana, S. Lawrence, C. L. Giles, Y. E. Wang, G.-Y. Wei, D. Brooks, C. Rudin, M. Walter, P. Wright, A. Bartosik, D. Dolciami, A. Elbasir, N. Fortelny, C. Bock, M. Abadi, P. Barham, Z. Chen, A. Davis, J. Dean, M. Devin, S. Ghemawat, G. Irving, M. Isard, M. Kudlur, J. Levenberg, R. Monga, S. Moore, D. G. Murray, B. Steiner, P. Tucker, V. Vasudevan, P. Warden, M. Wicke, Y. Yu, X. Zheng, A. Paszke, S. Gross, F. Massa, A. Lerer, G. Chanan, T. Killeen, Z. Lin, N. Gimelshein, L. Antiga, A. Desmaison, A. Köpf, E. Yang, Z. DeVito, M. Raison, A. Tejani, S. Chilamkurthy, L. Fang, S. Chintala, P. Zakeri, T. Haber, K. C. Bulusu, L. Kalash, M. A. Firth, Z. Ji, J. Su, H. Wang, D. Huang, X. Zhou, O. Weinreb, T. Amit, M. B. H. Youdim, N. L. Patel-Murray, M. Adam, N. Huynh, B. T. Wassie, P. Milani, E. Fraenkel, J. Vialard, P. Buijnsters, I. Velter, A. Vapirev, M. F. Cuccarese, B. A. Earnshaw, K. Heiser, B. Fogelson, P. F. McLean, H. B. Gordon, K.-R. Skelly, F. L. Weathersby, V. Rodic, I. K. Quigley, E. D. Pastuzyn, B. M. Mendivil, N. H. Lazar, C. A. Brooks, J. Carpenter, B. L. Probst, P. Jacobson, S. W. Glazier, J. Ford, J. D. Jensen, N. D. Campbell, M. A. Statnick, A. S. Low, K. R. Thomas, S. S. Hegde, R. W. Alfa, M. L. Victors, I. S. Haque, M. Kibble, N. Saarinen, F. Iorio, S. MĂ€kelĂ€, T. Aittokallio, M. Iwata, R. Sawada, H. Iwata, M. Kotera, Y. Yamanishi, E. Dazert, M. Colombi, T. Boldanova, S. Moes, D. Adametz, L. Quagliata, V. Roth, L. Terracciano, M. H. Heim, P. Jenoe, M. N. Hall, D. Carrella, F. Napolitano, R. Rispoli, M. Miglietta, A. Carissimo, L. Cutillo, F. Sirci, F. Gregoretti, D. Di Bernardo, A. Conesa, S. Beck Show less
The elucidation of a compound's Mechanism of Action (MoA) is a challenging task in the drug discovery process, but it is important in order to rationalise phenotypic findings and to anticipate potenti Show more
The elucidation of a compound's Mechanism of Action (MoA) is a challenging task in the drug discovery process, but it is important in order to rationalise phenotypic findings and to anticipate potential side-effects. Bioinformatic approaches, advances in machine learning techniques and the increasing deposition of high-throughput data in public databases have significantly contributed to recent advances in the field, but it is not straightforward to decide which data and methods are most suitable to use in a given case. In this review, we focus on these methods and data and their applications in generating MoA hypotheses for subsequent experimental validation. We discuss compound-specific data such as -omics, cell morphology and bioactivity data, as well as commonly used supplementary prior knowledge such as network and pathway data, and provide information on databases where this data can be accessed. In terms of methodologies, we discuss both well-established methods (connectivity mapping, pathway enrichment) as well as more developing methods (neural networks and multi-omics integration). Finally, we review case studies where the MoA of a compound was successfully suggested from computational analysis by incorporating multiple data modalities and/or methodologies. Our aim for this review is to provide researchers with insights into the benefits and drawbacks of both the data and methods in terms of level of understanding, biases and interpretation – and to highlight future avenues of investigation which we foresee will improve the field of MoA elucidation, including greater public access to -omics data and methodologies which are capable of data integration. Show less
📄 PDF DOI: 10.1039/d1cb00069a
ML review