đŸ‘€ D. E. John

🔍 Search 📋 Browse đŸ·ïž Tags ❀ Favourites ➕ Add 🧬 Extraction
8
Articles
7
Name variants
Also published as: Kristen M John, Peter, Arun T. John, Peters, John, Roland John, Roland O. John, Silke, John
articles
Gelman, Sam, Johnson, Bryce, Freschlin, Chase R. +5 more · 2025 · Nature Publishing Group · Nature · added 2026-04-20
Mutational effect transfer learning (METL) is a protein language model framework that unites machine learning and biophysical modeling. Transformer-based neural networks are pretrained on biophysical Show more
Mutational effect transfer learning (METL) is a protein language model framework that unites machine learning and biophysical modeling. Transformer-based neural networks are pretrained on biophysical simulation data to capture fundamental relationships between protein sequence, structure and energetics. Show less
📄 PDF DOI: 10.1038/s41592-025-02776-2
ML amino-acid
Jang, Yaan J., Qin, Qi-Qi, Huang, Si-Yu +3 more · 2024 · Nature Publishing Group · Nature · added 2026-04-20
Understanding protein function is vital for biomedicine. Here, authors develop a method using statistics-informed graph networks to predict functions from sequences. The method integrates evolutionary Show more
Understanding protein function is vital for biomedicine. Here, authors develop a method using statistics-informed graph networks to predict functions from sequences. The method integrates evolutionary couplings and residue communities to improve the accuracy of function annotations for proteins. Show less
📄 PDF DOI: 10.1038/s41467-024-50955-0
amino-acid
Vitale, Ilio, Pietrocola, Federico, Guilbaud, Emma +225 more · 2023 · Nature Publishing Group · Nature · added 2026-04-20
Vitale, Ilio, Pietrocola, Federico, Guilbaud, Emma, Aaronson, Stuart A., Abrams, John M., Adam, Dieter, Agostini, Massimiliano, Agostinis, Patrizia, Alnemri, Emad S., Altucci, Lucia, Amelio, Ivano, Andrews, David W., Aqeilan, Rami I., Arama, Eli, Baehrecke, Eric H., Balachandran, Siddharth, Bano, Daniele, Barlev, Nickolai A., Bartek, Jiri, Bazan, Nicolas G., Becker, Christoph, Bernassola, Francesca, Bertrand, Mathieu J. M., Bianchi, Marco E., Blagosklonny, Mikhail V., Blander, J. Magarian, Blandino, Giovanni, Blomgren, Klas, Borner, Christoph, Bortner, Carl D., Bove, Pierluigi, Boya, Patricia, Brenner, Catherine, Broz, Petr, Brunner, Thomas, Damgaard, Rune Busk, Calin, George A., Campanella, Michelangelo, Candi, Eleonora, Carbone, Michele, Carmona-Gutierrez, Didac, Cecconi, Francesco, Chan, Francis K. -M., Chen, Guo-Qiang, Chen, Quan, Chen, Youhai H., Cheng, Emily H., Chipuk, Jerry E., Cidlowski, John A., Ciechanover, Aaron, Ciliberto, Gennaro, Conrad, Marcus, Cubillos-Ruiz, Juan R., Czabotar, Peter E., D’Angiolella, Vincenzo, Daugaard, Mads, Dawson, Ted M., Dawson, Valina L., De Maria, Ruggero, De Strooper, Bart, Debatin, Klaus-Michael, Deberardinis, Ralph J., Degterev, Alexei, Del Sal, Giannino, Deshmukh, Mohanish, Di Virgilio, Francesco, Diederich, Marc, Dixon, Scott J., Dynlacht, Brian D., El-Deiry, Wafik S., Elrod, John W., Engeland, Kurt, Fimia, Gian Maria, Galassi, Claudia, Ganini, Carlo, Garcia-Saez, Ana J., Garg, Abhishek D., Garrido, Carmen, Gavathiotis, Evripidis, Gerlic, Motti, Ghosh, Sourav, Green, Douglas R., Greene, Lloyd A., Gronemeyer, Hinrich, HĂ€cker, Georg, HajnĂłczky, György, Hardwick, J. Marie, Haupt, Ygal, He, Sudan, Heery, David M., Hengartner, Michael O., Hetz, Claudio, Hildeman, David A., Ichijo, Hidenori, Inoue, Satoshi, JÀÀttelĂ€, Marja, Janic, Ana, Joseph, Bertrand, Jost, Philipp J., Kanneganti, Thirumala-Devi, Karin, Michael, Kashkar, Hamid, Kaufmann, Thomas, Kelly, Gemma L., Kepp, Oliver, Kimchi, Adi, Kitsis, Richard N., Klionsky, Daniel J., Kluck, Ruth, Krysko, Dmitri V., Kulms, Dagmar, Kumar, Sharad, Lavandero, Sergio, Lavrik, Inna N., Lemasters, John J., Liccardi, Gianmaria, Linkermann, Andreas, Lipton, Stuart A., Lockshin, Richard A., LĂłpez-OtĂ­n, Carlos, Luedde, Tom, MacFarlane, Marion, Madeo, Frank, Malorni, Walter, Manic, Gwenola, Mantovani, Roberto, Marchi, Saverio, Marine, Jean-Christophe, Martin, Seamus J., Martinou, Jean-Claude, Mastroberardino, Pier G., Medema, Jan Paul, Mehlen, Patrick, Meier, Pascal, Melino, Gerry, Melino, Sonia, Miao, Edward A., Moll, Ute M., Muñoz-Pinedo, Cristina, Murphy, Daniel J., Niklison-Chirou, Maria Victoria, Novelli, Flavia, NĂșñez, Gabriel, Oberst, Andrew, Ofengeim, Dimitry, Opferman, Joseph T., Oren, Moshe, Pagano, Michele, Panaretakis, Theocharis, Pasparakis, Manolis, Penninger, Josef M., Pentimalli, Francesca, Pereira, David M., Pervaiz, Shazib, Peter, Marcus E., Pinton, Paolo, Porta, Giovanni, Prehn, Jochen H. M., Puthalakath, Hamsa, Rabinovich, Gabriel A., Rajalingam, Krishnaraj, Ravichandran, Kodi S., Rehm, Markus, Ricci, Jean-Ehrland, Rizzuto, Rosario, Robinson, Nirmal, Rodrigues, Cecilia M. P., Rotblat, Barak, Rothlin, Carla V., Rubinsztein, David C., Rudel, Thomas, Rufini, Alessandro, Ryan, Kevin M., Sarosiek, Kristopher A., Sawa, Akira, Sayan, Emre, Schroder, Kate, Scorrano, Luca, Sesti, Federico, Shao, Feng, Shi, Yufang, Sica, Giuseppe S., Silke, John, Simon, Hans-Uwe, Sistigu, Antonella, Stephanou, Anastasis, Stockwell, Brent R., Strapazzon, Flavie, Strasser, Andreas, Sun, Liming, Sun, Erwei, Sun, Qiang, Szabadkai, Gyorgy, Tait, Stephen W. G., Tang, Daolin , Tavernarakis, Nektarios, Troy, Carol M., Turk, Boris, Urbano, Nicoletta, Vandenabeele, Peter, Vanden Berghe, Tom, Vander Heiden, Matthew G., Vanderluit, Jacqueline L., Verkhratsky, Alexei, Villunger, Andreas, von Karstedt, Silvia, Voss, Anne K., Vousden, Karen H., Vucic, Domagoj, Vuri, Daniela, Wagner, Erwin F., Walczak, Henning, Wallach, David, Wang, Ruoning, Wang, Ying, Weber, Achim, Wood, Will, Yamazaki, Takahiro, Yang, Huang-Tian, Zakeri, Zahra, Zawacka-Pankau, Joanna E., Zhang, Lin, Zhang, Haibing, Zhivotovsky, Boris, Zhou, Wenzhao, Piacentini, Mauro, Kroemer, Guido, Galluzzi, Lorenzo Show less
Apoptosis is a form of regulated cell death (RCD) that involves proteases of the caspase family. Pharmacological and genetic strategies that experimentally inhibit or delay apoptosis in mammalian syst Show more
Apoptosis is a form of regulated cell death (RCD) that involves proteases of the caspase family. Pharmacological and genetic strategies that experimentally inhibit or delay apoptosis in mammalian systems have elucidated the key contribution of this process not only to (post-)embryonic development and adult tissue homeostasis, but also to the etiology of multiple human disorders. Consistent with this notion, while defects in the molecular machinery for apoptotic cell death impair organismal development and promote oncogenesis, the unwarranted activation of apoptosis promotes cell loss and tissue damage in the context of various neurological, cardiovascular, renal, hepatic, infectious, neoplastic and inflammatory conditions. Here, the Nomenclature Committee on Cell Death (NCCD) gathered to critically summarize an abundant pre-clinical literature mechanistically linking the core apoptotic apparatus to organismal homeostasis in the context of disease. Show less
📄 PDF DOI: 10.1038/s41418-023-01153-w
Q. Dan, X. Dan, R. Jiang +1557 more · 2023 · Advanced Science · Wiley · added 2026-04-20
Q. Dan, X. Dan, R. Jiang, Z. Wang, D. Dai, L. Sun, A. Caschera, L. Lazzara, D. Piergallini, B. Ricci, A. Tuscano, F. Vanzulli, D. R. Czeyda‐Pommersheim, J. R. Martin, B. Costello, J. Kalb, N. Wallyn, S. Anton, T. F. Akram, S. N. Vandamme, M. A. Gandhi, J. G. Brown, D. A. Wong, C. B. Aguirre, N. Sirlin, E. Naseri, F. Ajorlou, Y. Asghari, N. Pilehvar‐Soltanahmadi, P. Tsapis, I. Dey, N. Blakey, V. T. C. Stone, X. Tsang, T. T. W. Li, G. S. Wong, K. D. Filonov, L.‐M. Piatkevich, J. Ting, K. Zhang, V. V. Kim, L. Verkhusha, A. R. Truong, P. Ferre‐D'Amare, P. J. Charalampaki, A. Proskynitopoulos, M. Heimann, A. J. Nakamura, M. G. Sinnamon, Y. Neuwirth, S. M. Song, S. Schultz, X. Liu, C. M. Xu, G. C. Sehgal, T. Karakousis, M. von Knorring, A. Mogensen, S. V. Upadhyay, D. Dalvi, A. Maresca, M. Lakshmanan, A. Abedi, A. Bar‐Zion, G. J. Farhadi, J. O. Lu, D. Szablowski, S. Wu, M. G. Yoo, N. Shapiro, S. von Knebel Doeberitz, L. Maksimovic, D. Loi, A. Paech, G. J. Lakshmanan, A. Lu, S. P. Farhadi, M. Nety, A. Kunth, D. Lee‐Gosselin, R. W. Maresca, M. Bourdeau, J. Yin, C. Yan, D. Witte, F. S. Malounda, L. Foster, M. G. Schroder, M. G. Shapiro, R. M. Shapiro, L. J. Ramirez, G. Sperling, J. Sun, A. Sun, D. V. Pines, V. S. Schaffer, H. Bajaj, M. W. Kang, S. Kang, H. S. Kashiwagi, V. H. Choi, A. E. Roberts, A. J. Frias, C. C. Fordham, N. Hacherl, K. Patel, B. Jones, M. Myers, J. Abraham, M. Gendreau, A. B. Ormo, K. Cubitt, L. A. Kallio, R. Y. Gross, S. J. Tsien, J. Remington, F. Wiedenmann, G. U. Oswald, N. C. Nienhaus, G. H. Shaner, M. W. Patterson, R. N. Davidson, M. W. Day, N. C. Davidson, R. E. Shaner, P. A. Campbell, B. N. G. Steinbach, A. E. Giepmans, R. Y. Palmer, M. M. Tsien, O. V. Karasev, K. A. Stepanenko, K. K. Rumyantsev, V. V. Turoverov, K. Verkhusha, C. Vintersten, M. Monetti, P. Z. Gertsenstein, L. Zhang, S. Laszlo, A. Biechele, A. Nagy, S. Amsterdam, N. Lin, T. Hopkins, A. Matsumoto, K. Suetsugu, M. Hasegawa, Y. Nakamura, H. Shibata, T. Aoki, H. Kunisada, M. Tsurumi, M. Shimizu, R. M. Bouvet, Q. T. Hoffman, E. S. Nguyen, T. A. Olson, T. Aguilera, M. Jiang, L. G. Scadeng, R. Y. Ellies, M. Tsien, B. Zhao, H. Li, F. Zhang, N. C. Zhang, J. C. Rockwell, S. H. Lagarias, S. J. Bhoo, J. Davis, B. Walker, R. D. Karniol, S. J. Vierstra, A. V. Davis, R. D. Vener, L. Vierstra, P. A. O'Brien, K. Hosick, D. E. John, T. D. Stec, X. Hinds, A. Shu, M. Z. Royant, T. A. Lin, V. Aguilera, P. A. Lev‐Ram, R. Y. Steinbach, K. D. Tsien, F. V. Piatkevich, V. V. Subach, D. M. Verkhusha, V. V. Shcherbakova, M. Shcherbakova, A. V. Baloban, M. Emelyanov, P. Brenowitz, V. V. Guo, R. Verkhusha, Y. Liu, K. Xu, Z. Xu, S. K. Dai, R. Donnelly, S. P. H. Cabrera, J. R. Mao, B. Christin, W. Wu, J. J. Guo, J. S. Bravo‐Cordero, J. E. Condeelis, L. Segall, D. M. Hodgson, O. V. Shcherbakova, K. K. Stepanenko, V. V. Baloban, J. S. Verkhusha, K. Y. Paige, S. R. Wu, E. V. Jaffrey, P. J. Dolgosheina, R. L. Unrau, M. D. Strack, S. R. Disney, K. D. Jaffrey, M. C. Warner, W. Chen, R. L. Song, A. Strack, S. R. Thorn, A. R. Jaffrey, A. Ferre‐D'Amare, E. Autour, M. Westhof, G. S. Ryckelynck, J. D. Filonov, N. Moon, S. R. Svensen, A. Jaffrey, S. C. Y. Autour, A. D. Jeng, A. Cawte, A. Abdolahzadeh, S. S. S. Galli, D. Panchapakesan, M. Rueda, P. J. Ryckelynck, A. Unrau, M. Arora, A. Sunbul, W. Jaeschke, G. S. Song, H. Filonov, M. Kim, X. Hirsch, J. D. Li, S. R. Moon, M. Jaffrey, J. I. Jaeschke, M. N. Traylor, A. C. Pernik, S. K. Sternisha, K. G. McBrayer, Y. Abdullah, Y. Harada, T. Murayama, E. Takamatsu, H. Otsuji, S. Tanaka, F. Broekx, S. Weyns, W. De Vleeschouwer, S. Stummer, S. Stocker, H. Wagner, C. Stepp, C. Fritsch, A. E. Goetz, R. Goetz, H. J. Kiefmann, W. Reulen, U. Stummer, T. Pichlmeier, O. D. Meinel, F. Wiestler, H. J. Zanella, A. L.‐G. S. Reulen, A. P. K. K. K. Group, R. Mudiyanselage, M. A. Wu, K. Leon‐Duque, M. Ren, J. You, J. Vachtenheim, E. Borovansky, I. Dimitrow, A. Riemann, M. J. Ehlers, J. Koehler, P. Norgauer, K. Elsner, M. Koenig, S. Kaatz, F. Seidenari, C. Arginelli, P. M. W. Dunsby, K. French, C. Koenig, C. Magnoni, G. Talbot, J. Ponti, P. Staley, A. K. Grogan, H. Samadi, M. S. Cui, X. Cohen, E. I. Yang, E. V. Galanzha, P. M. Shashkov, J. Y. Spring, V. P. Suen, E. I. Zharov, V. P. Galanzha, Z. Zharov, W. Habli, R. AlChamaa, H. Saab, M. L. Kadara, Y. Khraiche, F. Sun, Z. Ding, R. Chen, C. Zhang, Y. Li, Y. Xu, R. Zhang, X. Ni, G. Li, Y. Yang, P. J. Sun, B. Stang, X. Fan, X. Yang, S. Li, H. Lv, J. Zhang, L. Li, B. Wang, X. Qu, R. Peng, D. Zhang, D. Sheng, Y. Wang, K. Yao, Z. Yang, L. Wang, Y. Deng, S. Chen, M. Sirsi, L. Borden, S. V. Abou‐Elkacem, J. K. Bachawal, F. Willmann, F. Pfeifer, S. Pfeifer, P. DasSarma, A. Arora, A. Lakshmanan, A. Nety, R. W. Lee‐Gosselin, D. Bourdeau, M. G. Maresca, A. Shapiro, A. E. Oren, D. Walsby, J. M. Lee‐Gosselin, Y.‐L. Melis, R. W. Ni, D. M. Bourdeau, M. G. Kochmann, J. O. Shapiro, A. Szablowski, M. G. Bar‐Zion, P. W. Shapiro, A. Goodwill, M. Neogy, F. S. Yin, D. V. Foster, S. M. Schaffer, L. Conolly, J. Xie, T. Song, F. Jiang, R. C. Yan, M. T. Hurt, M. Buss, K. Duan, M. Y. Wong, D. P. You, M. B. Sawyer, P. Swift, P. Dutka, D. R. Barturen‐Larrea, Z. Mittelstein, M. H. Jin, R. Farhadi, M. G. Deshpande, G. H. Farhadi, D. P. Ho, R. W. Sawyer, M. G. Bourdeau, D. Shapiro, T. Maresca, A. Payen, B. Lee‐Gosselin, D. Ling, C. Malounda, M. Demene, M. G. Tanter, Z. Lakshmanan, S. P. Jin, D. P. Nety, A. Sawyer, M. B. Malounda, D. Swift, T. Hao, F. Ai, X. Goerner, V. M. Hu, M. Runge, K. M. Tweedle, A. H. Ward, R. S. Aletras, L. Balaban, T. J. Schroeder, C. Lowery, D. E. Hilty, A. Wemmer, J. J. Pines, J. Neil, A. M. Badaut, A. Fukuda, K. G. Jullienne, Y. Petry, V. S. Jasanoff, E. Lelyveld, F. H. Brustad, A. Arnold, S. M. Jasanoff, J. M. Cohen, J. G. Rifkind, E. Mohanty, P. C. M. Nagababu, S. M. van Zijl, J. A. Eleff, J. M. E. Ulatowski, A. M. Oja, R. J. Ulug, R. A. Traystman, K. Kauppinen, P. Uludag, J. P. B. Blinder, S. P. O'Connor, J. C. Robinson, H. Waterton, G. Kroll, T. Zaharchuk, J. J. Christen, M. Heit, B. Iv, G. Jacobi, S. Bongartz, A.‐C. Partovi, M. Schulte, A. B. Aschwanden, M. G. Lumsden, M. Davies, G. P. Loebe, S. Noon, J. K. Karimi, D. Lyo, R. W. Staub, D. Huegli, M. G. Bilecen, G. G. Shapiro, P. A. Westmeyer, J. O. Romero, B. Szablowski, A. Kuester, C. R. Shah, R. Otey, F. H. Langer, A. Jasanoff, L. X. Hai, T. Cai, V. S. Lee, A. Lelyveld, T. Jasanoff, L. X. Lee, V. S. Cai, A. Hai, H. Jasanoff, B. Gunshin, U. V. Mackenzie, Y. Berger, M. F. Gunshin, W. F. Romero, S. Boron, J. L. Nussberger, M. A. Gollan, B. B. Hediger, K. U. Bartelle, G. A. Szulc, J. J. Suero‐Abreu, D. H. Rodriguez, C. M. Turnbull, S. A. Lewis, R. Graves, H. F. Hernandez, T. E. Valdovinos, W. Barnhart, M. E. Cai, R. J. Meyerand, M. Nickles, P. M. Suzuki, P. Harrison, A. Arosio, J. R. Yevenes, J. Harris, Y. Marles‐Wright, R. N. Gossuin, P. Muller, L. Gillis, A. E. Bartel, Y. Z. Deans, L. M. Wadghiri, X. Bernas, B. K. Yu, D. H. Rutt, X. Turnbull, J. He, B. Cai, Y. Zhong, A. V. Qin, H. Naumova, V. Reinecke, J. Yarnykh, C. Deem, C. E. Yuan, M. Murry, V. Campan, G. D. Lionetti, F. Aquaro, M. Forini, L. Matteucci, F. Vannucci, C. Chiuppesi, M. Di Cristofano, M. Faggioni, L. Maioli, E. Barile, M. Messina, A. Lombardi, M. Pucci, F. A. Pistello, B. Recchia, E. T. Iordanova, C. Ahrens, J. Song, C. Wang, S. Mo, X. Mu, X. Jiang, Z. Zhong, G. Zhao, Y. Zhou, F. Zhuo, L. Chen, T. Kong, J. Lu, T. Yang, X. Yu, K. Shi, H. S. Li, J. Kim, J. H. Woo, H. J. Lee, Y. Joo, H. Choi, W. K. Kim, S. J. Moon, K. Kim, C. M. Bernau, A. M. Lewis, M. S. Petelinsek, D. J. Reagan, V. B. Niles, E. Mattis, M. Meyerand, C. N. Suzuki, M. Svendsen, H. Wang, F. He, Y. Gao, S. C. Guo, L. J. Beeman, J. F. Mandarino, K. M. Georges, P. C. Bennett, J. M. Ulatowski, F. Kauppinen, C. Mickoleit, S. Jorke, D. S. Geimer, J. P. Maier, J. Muller, C. Demut, D. Grafe, J. H. Schuler, J. Clement, E. C. H. Liu, R. C. Cheng, S.‐H. Long, L. Yang, P.‐H. Wang, J. Cheng, D. Yang, H. Wu, A. W. S. Mao, S. M. Chan, D. Pereira, S. R. Moss, P. Williams, A. Murray, B. Taylor, X. Todorich, B. Zhang, W. E. Slagle‐Webb, J. R. Seaman, T. T. Connor, D. H. Li, C. D. C. Chung, S. V. Allen, F. M. Torti, J. G. Torti, C. Y. Cyster, F. M. Chen, E. C. Brodsky, M. C. Niemi, W. E. Nakamura, M. R. Seaman, P. S. Daws, T. B. Patrick, M. I. Rodrigues, S. K. Kettunen, A. A. Lyons, K. M. Neves, R. Brindle, R. Blakemore, D. Uebe, S. Schueler, M. Meriaux, B. Boucher, Y. Marty, S. Lalatonne, L. Preveral, C. T. Motte, F. Lefevre, F. Geffroy, M. Lethimonnier, D. Pean, G. Garcia, D. Adryanczyk‐Perrier, N. Pignol, T. Ginet, S. Orlando, E. Mannucci, G. Fantechi, S. Conti, A. Tambalo, C. Busato, L. Innocenti, R. Ghin, P. Bassi, F. Arosio, C. Orsini, M. Sangregorio, M. F. Corti, P. Casula, A. Marzola, A. Lascialfari, P. Sbarbati, M. D. Tartaj, S. Morales, T. Veintemillas‐Verdaguer, C. J. Gonzalez‐Carreno, K. Serna, C. Grunberg, B. M. Wawer, D. Tebo, Z. Schuler, X. Xiang, J. Yang, W. Xu, Z. Lai, J. Hu, L. Tian, Q. Geng, E. Fang, M. Erdal, Y. Demirbilek, O. Yeh, L. Akbal, D. Ruff, A. Bozkurt, Y. Cabuk, B. Senel, O. Gumuskaya, S. Algin, S. Colak, E. B. Esener, M. Denkbas, F. Boucher, S. Geffroy, E. Bellanger, G. Selingue, M. Adryanczyk‐Perrier, C. T. Pean, D. Lefevre, S. Ginet, D. E. Meriaux, R. Goldhawk, A. Rohani, N. Sengupta, F. S. Gelman, K. M. Prato, A. C. Jones, M. D. Pollard, B. Pagel, G. Wu, M. Warnock, C. Zaiss, M. Lin, Z. Chen, L. Zhou, D. Mu, R. Nanz, G. Tuura, Y. Delso, Y. Jia, K. Chen, Y. Geng, Y. Cheng, J. Li, H. Qiu, R. Huang, R. P. R. Krishnamoorthy, P. Nanga, H. Bagga, R. Hariharan, S. Reddy, M. Chen, Y. Jiang, B. Yuan, Z.‐X. Zhang, C. Jiang, X. Ye, C. Yuan, S. Wang, J. Kuddannaya, D. R. Zhang, Z. Arifin, P. Han, G. Walczak, J. W. M. Liu, P. C. M. Bulte, N. N. van Zijl, G. Yadav, K. W. Y. Song, M. T. Chan, M. T. McMahon, A. A. McMahon, J. Y. Gilad, P. Z. Zhou, J. W. M. Sun, J. Y. van Zijl, J. F. Zhou, D. A. Payen, R. J. Wilson, P. C. M. Traystman, N. van Zijl, A. X. McVicar, D. F. Li, M. Goncalves, S. O. Bellyou, M. A. M. Meakin, R. Prado, A. Bartha, Y. Sakata, T. Fushimi, Y. Okada, T. Arakawa, S. Kunieda, A. Minamiguchi, N. Kido, S. Sakashita, K. Miyamoto, B. Togashi, K. Joo, Y. S. Han, S.‐K. Choi, S. S. Lee, J. H. Ahn, S.‐G. Chang, S. H. Kang, C. Zhou, C. Su, L. Liu, J. Zhao, J. Jiang, S. Zhang, W. Li, J. Zhu, Y. S. Wang, S. S. Choi, S.‐K. Ahn, J. H. Lee, S. Zhou, C. G. Jiang, Y. Eberhart, H.‐Y. Zhang, Z. Heo, L. Wen, H. Blair, M. Qin, A. Lim, J. D. Quinones‐Hinojosa, P. B. Weingart, M. G. Barker, J. Pomper, P. C. M. Laterra, J. O. van Zijl, J. Blakeley, H. Zhou, H. Yu, T. Lou, X. Zou, Z. Jiang, Y. Huang, C. Du, L. Jiang, J. Ma, W. Zhu, Q. He, J. Rui, Z. Zhou, S. Wen, H. Jiang, Y. Lu, Y. Feng, D.‐H. Heo, J. Lee, C. Wen, X. Su, M. Zhou, S.‐Y. Wang, M. Li, J.‐Y. Chen, D.‐T. Zhou, C. Peng, Y.‐M. Zhang, M. Dai, X. Wang, C.‐F. Hong, Q. Chang, B. Li, H. Ma, H.‐Y. Xiang, Y. Heo, D.‐H. Zhang, S. Lee, R. C. Leigh, P. C. M. Koehler, J. van Zijl, J. Wang, H.‐K. Zhou, K. Jeong, J. Han, Y. S. Zhao, X. Ahn, Y. Ma, Y. Bai, X. Lin, T. Hong, E. M. Ma, J. Haacke, J. Zhou, M. Wang, P. C. M. Zhou, G. W. J. van Zijl, Y. K. Harston, N. Tee, T. W. Blockley, S. Okell, G. Thandeswaran, F. Shaya, M. Sheerin, S. Cellerini, P. Payne, M. Jezzard, J. Chappell, A. Kennedy, J. Tietze, I. K. Blicher, L. Mikkelsen, M. K. Ostergaard, S. A. Strother, M. J. Smith, R. J. Donahue, T. F. Harris, L. M. Cloughesy, P. L. Liau, A. Nghiemphu, W. B. Lai, B. M. Pope, R. J. Ellingson, R. M. Liau, J. P. Prins, D. Antonios, W. H. Li, W. B. Yong, A. Pope, P. L. Lai, B. M. Nghiemphu, K. Ellingson, A. Cai, D. R. Singh, R. P. R. Roalf, M. Nanga, H. Haris, R. Gur, K. Reddy, M. Cai, A. Haris, F. Singh, J. H. Kogan, H. Greenberg, J. A. Hariharan, R. Detre, F. Reddy, A. Kogan, C. Singh, M. Debrosse, K. Haris, R. P. Cai, H. Elliott, K. A. Reddy, R. P. R. Davis, S. Nanga, S. H. Das, P. N. Chen, J. R. Hadar, T. H. Pollard, R. T. Lucas, B. Shinohara, H. Litt, M. A. Hariharan, J. A. Elliott, D. R. Reddy, P. E. Nanga, H. Rupert, M. Hariharan, M. E. Quarmley, E. Calkins, K. Dress, M. A. Prabhakaran, P. J. Elliott, R. C. Moberg, R. E. Gur, B. I. Reddy, K. P. Turetsky, A. N. O'Grady, B. D. Dula, L. M. Lyttle, B. N. Thompson, B. A. Conrad, L. J. Box, S. McKeithan, F. Pawate, B. A. Bagnato, P. Landman, S. A. Newhouse, M. Smith, K. Nath, R. Singh, F. Crescenzi, G. Kogan, S. Verma, H. Reddy, E. R. Hariharan, R. Melhem, P. Reddy, S. Bagga, R. Pickup, D. Crescenzi, A. Martinez, K. Borthakur, A. D'Aquilla, G. Singh, J. A. Verma, J. Detre, J. Reddy, L. Pepin, M.‐A. Francelle, L. Carrillo‐de Sauvage, P. de Longprez, K. Gipchtein, J. Cambon, E. Valette, J. Brouillet, W. Flament, R. R. Ling, G. Regatte, A. Navon, S. Jerschow, A. J. R. Glyn‐Jones, R. Palmer, A. J. Agricola, T. L. Price, H. Vincent, A. J. Weinans, Y. H. Carr, H.‐K. Yang, J.‐S. Jeong, S. Suh, R. Brinkhof, V. Nizak, J. J. Khlebnikov, D. W. J. Prompers, D. B. F. Klomp, X. Saris, N. N. Xu, L. Yadav, J. Knutsson, R. Hua, E. Kalyani, J. Hall, J. Laterra, R. Blakeley, M. Strowd, P. Pomper, K. W. Y. Barker, G. Chan, M. T. Liu, R. D. McMahon, P. C. M. Stevens, K.‐P. Weygand, A. S. R. Hwang, Y. Mohamed, C. D. Ding, S. Y. Fuller, S. J. Lai, J. Frank, K. W. Y. Zhou, Y. McMahon, G. Kato, Z. M. Bulte, D. Bhujwalla, P. C. M. Artemov, S. van Zijl, R. Walker‐Samuel, F. Ramasawmy, M. Torrealdea, V. Rega, S. P. Rajkumar, S. Johnson, M. Richardson, H. G. Goncalves, E. Parkes, D. L. Arstad, R. B. Thomas, M. F. Pedley, X. Lythgoe, P. C. M. Golay, C. K. van Zijl, J. Jones, C. R. Ren, A. D. Malloy, C. O. Sherry, J. Miller, E. Y. Cao, B. M. Chekmenev, A. D. Damon, J. C. Cherrington, G. L. Gore, A. J. W. Simegn, F. C. Van der Kouwe, E. M. Robertson, A. Meintjes, M. Alhamud, R. Wyss, K. Kaddurah‐Daouk, R.‐W. Cai, X. J. Tain, F. C. Zhou, A. M. Damen, H. Scotti, H. Hariharan, R. Poptani, H. Singh, W. Poptani, H. Lu, X. J. Hariharan, R. Zhou, Z. Reddy, Y. Nguyen, J. L. Chen, Z. Shaw, E. Dawkins, D. Marbyn, C. Li, R. P. R. DeBrosse, N. Nanga, K. Wilson, M. D'Aquilla, F. Hariharan, K. Yan, N. Wade, D. Sara, C. Worsley, E. Parris‐Skeete, R. McCormick, Z. Z. Xiao, L. Cunningham, K. L. Fishbein, D. R. Nathanson, V. A. Lynch, M. Stallings, M. J. Yudkoff, R. Falk, S. E. Reddy, X.‐Y. McCormack, F. Xie, E. C. Wang, J. Lin, D. F. Xu, J. C. Gochberg, Z. Gore, S. Zu, A. A. Meier, J. A. Gilad, C. Brandon, E. Qian, J. F. Gao, M. Abisambra, M. J. Vandsburger, P. C. M. Donahue, S. Donahue, C. R. Rane, M. K. Thompson, A. O. Strother, S. A. Scott, Z. Smith, F. Hu, X. Huang, X. Guo, S. Quan, X. Zhou, Z. Zhao, F. Wen, S. Huang, X. Lu, D. Hu, J. Zu, K. Zhou, Z. Yan, C. Fu, K. Yang, D.‐H. Jiang, H.‐Y. Lee, R. N. Zhang, J. E. Cole, J. Van Eyk, J. Zaiss, S. Windschuh, D. Goerke, J.‐E. Paech, S. Meissner, P. Burth, W. Kickingereder, M. Wick, H.‐P. Bendszus, M. E. Schlemmer, P. Ladd, A. Bachert, C. K. Radbruch, M. J. Jones, P. C. M. Schlosser, M. G. van Zijl, X. Pomper, J. Golay, J. O. Zhou, M. Hua, M. G. Laterra, P. C. M. Pomper, M. Zhu, L. Lim, A. Blair, S. A. Quinones‐Hinojosa, C. G. Messina, M. G. Eberhart, P. B. Laterra, P. C. M. Barker, A. N. Blakeley, S. Dula, L. M. Pawate, B. N. Dethrage, B. E. Conrad, R. L. Dewey, S. A. Barry, A. N. Smith, E. M. Dula, B. A. Asche, E. B. Landman, S. Welch, S. Pawate, J. C. Sriram, S. A. Gore, J. A. Smith, J. M. Wells, H. E. O'Callaghan, N. M. Holmes, R. A. Powell, B. Johnson, F. Siow, O. Torrealdea, S. Ismail, X. Walker‐Samuel, M. Golay, S. Rega, M. J. Modat, S. Cardoso, A. J. Ourselin, Z. Schwarz, T. K. Ahmed, M. J. Murray, E. C. O'Neill, N. Collins, M. F. Colgan, J. Lythgoe, C. van Zijl, A. Schleich, L. Mueller‐Lutz, J. Zimmermann, B. Boos, H.‐J. Schmitt, G. Wittsack, F. Antoch, M. Miese, Q. Kim, M.‐P. Chan, K. M. C. Anthony, D. Cheung, P.‐L. Samartzis, C. Khong, M. Mueller‐Lutz, B. Eichner, F. Schmitt, B. Matuschke, C. Bittersohl, H.‐J. Zilkens, C. Miese, F. Mueller‐Lutz, P. Matuschke, R. Sewerin, B. Sengewein, B. Schmitt, H.‐J. Ostendorf, K. Wittsack, G. Stanke, R. P. R. Haris, A. Nanga, K. Singh, F. Cai, H. Kogan, M. Kogan, C. Cai, H. Nanga, J. J. Reddy, T. Chung, J. H. Jin, S.‐G. Lee, E. Kim, M. Rerich, A. Zaiss, M. E. Korzowski, F. Bachert, R. B. Kogan, E. K. Stafford, G. E. Englund, H. Gold, R. Reddy, D. Bammer, P. W. Le Bihan, P. E. Schaefer, R. G. Grant, L. Gonzalez, M. Zhang, Z. Tang, J. Min, X. Lei, N. M. Henderson, K. de Souza, S. F. Thomas, V. A. Riches, S. A. Morgan, D. P. Sohaib, C. C. Dearnaley, N. J. Parker, V. van As, R. Granata, O. Fusco, B. Catalano, F. Guarino, F. Granata, A. Tatangelo, M. Avallone, R. Piccirillo, F. Palaia, A. Izzo, P. Petrillo, L. S. Agre, M. King, W. B. Yasui, O. P. Guggino, Y. Ottersen, A. Fujiyoshi, S. Engel, I. Nielsen, A. Direito, M. A. Madeira, G. Brito, G. Soveral, G.‐Y. Tang, H. Tomita, A. J. Dorward, E. Yool, A. R. Smith, T. J. Townsend, J. E. Price, A. S. Hardingham, A. J. Verkman, P.‐w. Smith, L. Phuan, M. O. Tradtrantip, J. A. Anderson, J. I. Hubbard, D. K. Szu, E. A. Binder, O. P. Nagelhus, M. C. Ottersen, A. S. Papadopoulos, C. Verkman, E. Iacovetta, R. Rudloff, M. Kirby, G. Xiao, B. Hu, Y. Desai, B. Hsu, J. G. Schneller, A. I. Hobbs, A. Mehta, S. Linninger, M. C. Saadoun, A. M. Papadopoulos, J. Fukuda, H. Badaut, C. Chu, H. Huang, J. Ding, Z. Dong, X. Gao, Q. Tang, C. Dong, J. Mai, T. Li, T. Wang, Y.‐L. Lu, J. Lan, T. Zhao, S. Ma, Y.‐L. Li, X. Lan, J.‐C. Wang, X.‐C. Lou, B. Ma, V. Zhang, F. Gradinaru, J. Ramakrishnan, R. Mattis, I. Prakash, I. Diester, K. R. Goshen, K. Thompson, Y.‐W. Deisseroth, P. Shieh, P. Minguez, J. J. Bork, D. L. Auburger, G. Guilbride, B. Kramer, E. Bukau, J. N. Natan, S. A. Wells, J. A. Teichmann, A. Marsh, H. C. Mukherjee, P. Davis, G. J. Ramesh, M. G. Lu, Y. Shapiro, B. W. Wang, E. J. Roose, V. Palovcak, I. J. Carnevale, J. P. F. Dmochowski, K. Werner, Y. Mishra, P. Huang, S. Vetschera, A. Glasl, K. Chmyrov, V. Richter, A. C. Ntziachristos, P. Stiel, K. Vetschera, J. P. Mishra, A. Fuenzalida‐Werner, V. Chmyrov, K. Stiel, K. Ono, K. Fuma, M. Tabata, H. S. Sawada, H. R. Kim, S. H. Cho, J. S. Choi, W. K. Woo, Y. Moon, H. S. Choi, K.‐W. Kim, K.‐M. Cho, Y. J. Lee, S.‐J. Yi, H. J. Eun, S. H. Woo, T.‐K. Choi, C. Whangbo, D.‐Y. Choi, W. K. Noh, S. Moon, R. Cheng, Y. Mi, G. Xu, J. Jin, Y. Zhang, F. Chen, C. Liu, D. Jiang, E. M. Wu, B. Haacke, H. Cohen, G. Dafni, A. Meir, M. Harmelin, M.‐R. Neeman, A. Lisy, C. Hartung, D. Lang, W. Schueler, J. R. Richter, W. A. Reichenbach, I. Kaiser, A. Hilger, Y. Bar‐Shir, K. W. Y. Liang, A. A. Chan, J. W. M. Gilad, D. I. Bulte, A. Piraner, H. C. Farhadi, D. Davis, D. Wu, J. O. Maresca, M. G. Szablowski, G. Farhadi, M. Ho, B. Kunth, A. Ling, R. W. Lu, L. Bourdeau, M. G. Schroeder, G. J. Shapiro, A. Farhadi, M. G. Mukherjee, J. O. Farhadi, S. R. Lee‐Gosselin, A. Barnes, R. W. Lakshmanan, M. Shapiro, E. Bekiesinska‐Figatowska, K. Sawicka, O. Zak, J. Szczygielski, L. Stritzker, M. Kirscher, N. C. Scadeng, S. Deliolanis, P. Morscher, K. Symvoulidis, Q. Schaefer, M. Buckel, U. Hess, W. G. Donat, V. Bradley, A. A. Ntziachristos, T. Szalay, A. Repenko, A. Rix, J. Nedilko, A. Rose, R. Hermann, S. Vinokur, R. Moli, M. Cao‐Milan, G. Mayer, A. von Plessen, L. Fery, W. De Laporte, D. N. Lederle, A. J. C. Chigrin, J. E. Kuehne, Z. Lemaster, A. Wang, F. Hariri, Y. Hu, C. V. Huang, R. Barback, N. C. Cochran, J. V. Gianneschi, R. J. Jokerst, A. E. Paproski, K. Forbrich, M. M. Wachowicz, R. J. Hitt, A. Zemp, F. Farhadi, G. G. Sigmund, M. G. Westmeyer Show less
Abstract Imaging contrast agents are widely investigated in preclinical and clinical studies, among which biogenic imaging contrast agents (BICAs) are developing rapidly and playing an increasingly i Show more
Abstract Imaging contrast agents are widely investigated in preclinical and clinical studies, among which biogenic imaging contrast agents (BICAs) are developing rapidly and playing an increasingly important role in biomedical research ranging from subcellular level to individual level. The unique properties of BICAs, including expression by cells as reporters and specific genetic modification, facilitate various in vitro and in vivo studies, such as quantification of gene expression, observation of protein interactions, visualization of cellular proliferation, monitoring of metabolism, and detection of dysfunctions. Furthermore, in human body, BICAs are remarkably helpful for disease diagnosis when the dysregulation of these agents occurs and can be detected through imaging techniques. There are various BICAs matched with a set of imaging techniques, including fluorescent proteins for fluorescence imaging, gas vesicles for ultrasound imaging, and ferritin for magnetic resonance imaging. In addition, bimodal and multimodal imaging can be realized through combining the functions of different BICAs, which helps overcome the limitations of monomodal imaging. In this review, the focus is on the properties, mechanisms, applications, and future directions of BICAs. Show less
📄 PDF DOI: 10.1002/advs.202207090
Fe amino-acid imaging review
Galluzzi, Lorenzo, Vitale, Ilio, Aaronson, Stuart A. +166 more · 2018 · Nature Publishing Group · Nature · added 2026-04-20
Galluzzi, Lorenzo, Vitale, Ilio, Aaronson, Stuart A., Abrams, John M., Adam, Dieter, Agostinis, Patrizia, Alnemri, Emad S., Altucci, Lucia, Amelio, Ivano, Andrews, David W., Annicchiarico-Petruzzelli, Margherita, Antonov, Alexey V., Arama, Eli, Baehrecke, Eric H., Barlev, Nickolai A., Bazan, Nicolas G., Bernassola, Francesca, Bertrand, Mathieu J. M., Bianchi, Katiuscia, Blagosklonny, Mikhail V., Blomgren, Klas, Borner, Christoph, Boya, Patricia, Brenner, Catherine, Campanella, Michelangelo, Candi, Eleonora, Carmona-Gutierrez, Didac, Cecconi, Francesco, Chan, Francis K.-M., Chandel, Navdeep S., Cheng, Emily H., Chipuk, Jerry E., Cidlowski, John A., Ciechanover, Aaron, Cohen, Gerald M., Conrad, Marcus, Cubillos-Ruiz, Juan R., Czabotar, Peter E., D’Angiolella, Vincenzo, Dawson, Ted M., Dawson, Valina L., De Laurenzi, Vincenzo, De Maria, Ruggero, Debatin, Klaus-Michael, Deberardinis, Ralph J., Deshmukh, Mohanish, Di Daniele, Nicola, Di Virgilio, Francesco, Dixit, Vishva M., Dixon, Scott J., Duckett, Colin S., Dynlacht, Brian D., El-Deiry, Wafik S., Elrod, John W., Fimia, Gian Maria, Fulda, Simone, GarcĂ­a-SĂĄez, Ana J., Garg, Abhishek D., Garrido, Carmen, Gavathiotis, Evripidis, Golstein, Pierre, Gottlieb, Eyal, Green, Douglas R., Greene, Lloyd A., Gronemeyer, Hinrich, Gross, Atan, Hajnoczky, Gyorgy, Hardwick, J. Marie, Harris, Isaac S., Hengartner, Michael O., Hetz, Claudio, Ichijo, Hidenori, JÀÀttelĂ€, Marja, Joseph, Bertrand, Jost, Philipp J., Juin, Philippe P., Kaiser, William J., Karin, Michael, Kaufmann, Thomas, Kepp, Oliver, Kimchi, Adi, Kitsis, Richard N., Klionsky, Daniel J., Knight, Richard A., Kumar, Sharad, Lee, Sam W., Lemasters, John J., Levine, Beth, Linkermann, Andreas, Lipton, Stuart A., Lockshin, Richard A., LĂłpez-OtĂ­n, Carlos, Lowe, Scott W., Luedde, Tom, Lugli, Enrico, MacFarlane, Marion, Madeo, Frank, Malewicz, Michal, Malorni, Walter, Manic, Gwenola, Marine, Jean-Christophe, Martin, Seamus J., Martinou, Jean-Claude, Medema, Jan Paul, Mehlen, Patrick, Meier, Pascal, Melino, Sonia, Miao, Edward A., Molkentin, Jeffery D., Moll, Ute M., Muñoz-Pinedo, Cristina, Nagata, Shigekazu, Nuñez, Gabriel, Oberst, Andrew, Oren, Moshe, Overholtzer, Michael, Pagano, Michele, Panaretakis, Theocharis, Pasparakis, Manolis, Penninger, Josef M., Pereira, David M., Pervaiz, Shazib, Peter, Marcus E., Piacentini, Mauro, Pinton, Paolo, Prehn, Jochen H.M., Puthalakath, Hamsa, Rabinovich, Gabriel A., Rehm, Markus, Rizzuto, Rosario, Rodrigues, Cecilia M.P., Rubinsztein, David C., Rudel, Thomas, Ryan, Kevin M., Sayan, Emre, Scorrano, Luca, Shao, Feng, Shi, Yufang, Silke, John, Simon, Hans-Uwe, Sistigu, Antonella, Stockwell, Brent R., Strasser, Andreas, Szabadkai, Gyorgy, Tait, Stephen W.G., Tang, Daolin , Tavernarakis, Nektarios, Thorburn, Andrew, Tsujimoto, Yoshihide, Turk, Boris, Vanden Berghe, Tom, Vandenabeele, Peter, Vander Heiden, Matthew G., Villunger, Andreas, Virgin, Herbert W., Vousden, Karen H., Vucic, Domagoj, Wagner, Erwin F., Walczak, Henning, Wallach, David, Wang, Ying, Wells, James A., Wood, Will, Yuan, Junying, Zakeri, Zahra, Zhivotovsky, Boris, Zitvogel, Laurence, Melino, Gerry, Kroemer, Guido Show less
Over the past decade, the Nomenclature Committee on Cell Death (NCCD) has formulated guidelines for the definition and interpretation of cell death from morphological, biochemical, and functional pers Show more
Over the past decade, the Nomenclature Committee on Cell Death (NCCD) has formulated guidelines for the definition and interpretation of cell death from morphological, biochemical, and functional perspectives. Since the field continues to expand and novel mechanisms that orchestrate multiple cell death pathways are unveiled, we propose an updated classification of cell death subroutines focusing on mechanistic and essential (as opposed to correlative and dispensable) aspects of the process. As we provide molecularly oriented definitions of terms including intrinsic apoptosis, extrinsic apoptosis, mitochondrial permeability transition (MPT)-driven necrosis, necroptosis, ferroptosis, pyroptosis, parthanatos, entotic cell death, NETotic cell death, lysosome-dependent cell death, autophagy-dependent cell death, immunogenic cell death, cellular senescence, and mitotic catastrophe, we discuss the utility of neologisms that refer to highly specialized instances of these processes. The mission of the NCCD is to provide a widely accepted nomenclature on cell death in support of the continued development of the field. Show less
📄 PDF DOI: 10.1038/s41418-017-0012-4
Fe immunogenic mitochondria
Wolfgang Kandioller, Christian G. Hartinger, Alexey A. Nazarov +6 more · 2009 · Journal of Organometallic Chemistry · Elsevier · added 2026-05-01
📄 PDF DOI: 10.1016/j.jorganchem.2008.10.016
Biometal
Raffael Schuecker, Roland O. John, Michael A. Jakupec +2 more · 2008 · Organometallics · ACS Publications · added 2026-05-01
📄 PDF DOI: 10.1021/om800774t
Biometal
Wolfgang F. Schmid, Roland O. John, Vladimir B. Arion +2 more · 2007 · Organometallics · ACS Publications · added 2026-05-01
📄 PDF DOI: 10.1021/om700813c
Biometal